很多时候，我们都无法确定到底是基于symbol来进行分析，还是基于entrez ID，当我们要进行ID转换的时候也想当然的以为它们的一一对应的， 但是最近我写了一个脚本来分析CCLE的数据的时候，发现其实有一些特例:
suppressMessages(library(org.Hs.eg.db))
all_symbol=mappedkeys(org.Hs.egSYMBOL2EG)
all_EGID =mappedkeys(org.Hs.egSYMBOL)
tmp=as.list(org.Hs.egSYMBOL2EG[all_symbol])
#tmp=as.list(org.Hs.egSYMBOL[all_EGID ])
tmp=unlist(lapply(tmp,length))
tmp=tmp[tmp>1]
as.list(org.Hs.egSYMBOL2EG[names(tmp)])
有多个entrez ID对应一个symbol的现象出现,但是没有一个symbol对应多个entrez ID的现象。而且entrez ID也会过期！
$CSNK1E
[1] "1454" "102800317"
$HBD
[1] "3045" "100187828"
$RNR1
[1] "4549" "6052"
$RNR2
[1] "4550" "6053"
$SFPQ
[1] "6421" "654780"
$TEC
[1] "7006" "100124696"
$MEMO1
[1] "7795" "51072"
$KIR3DL3
[1] "115653" "100133046"
$MMD2
[1] "221938" "100505381"
$`LSAMP-AS1`
[1] "100506708" "101926903"
通过下面的链接可以看到具体情况