Post navigation ← Previous Next → 用R的shiny包写一个基因的ID转换小程序 Posted on 2016年2月28日 by ulwvfje 基因的ID现在可能有一千多种,但是我们一般只用NCBI的entrez ID,和HUGO组装规定的gene symbol和gene name 再者有人会用ensembl的ID,至于UCSC的ID很少人用了,更别说剩余的一大堆稀奇古怪的ID了。 http://www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?gene=TP53 其实没必要自己写一个软件来转换,因为非常多的现成软件都可以做到! 不过可以拿这个简单的任务来练手! 首先自己做好数据库文件: 我是把数据写到了一个sqlite文件里面了!结构很简单 然后设计软件的界面,俗称UI端,也是很容易,在shiny里面,记住几个控件的函数即可! 具体代码见我的github代码:https://github.com/jmzeng1314/my-R/tree/master/4-ID-convert-using-shiny