目录
一:文献解读
二:NCBI搜索
三:构建脚本下载所有reads压缩包
四:用sra-toolkit解压
正文
一:文献解读
NCBI的原始reads数据里面最重要的就是SRP023104这样的字符串,能定位下载数据,也能定位原始文献。
文献地址如下
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4036802/
该研究小组还做了很多关于这个足部疾病的工作,其它文献地址如下
https://www.hgsc.bcm.edu/human/charcot-marie-tooth-project
二:NCBI搜索
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/SRX852869[accn]
SRX852869: PacBio whole genome sequencing of Homo sapien personal sample HS-1011
88 PACBIO_SMRT (PacBio RS II) runs: 14.4M spots, 89.6G bases, 319.9Gb downloads
这些数据都是可以下载的!!!
如果有多余服务器资源,可以考虑下载玩玩这些数据!
这是很久以前的一个草稿帖子了,居然忘记发了,正好我开始有新的服务器了,一定要抽空玩一下三代测序啦!