把TCGA的乳腺癌患者按照年龄分层来比较突变情况

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看起来只是一个摘要，并没有相关文章出来： http://ascopubs.org/doi/abs/10.1200/jco.2015.33.15_suppl.579

很奇怪，但是值得学习一下。

在乳腺癌领域，这个划分是很有意义的，因为45岁之前就患乳腺癌通常是家族性或者遗传性的，需要各位关注。

959 (138 < 45y) and 788 (124 ≥ 45y)

结论很简单：

  • Young age at diagnosis was associated with less number of somatic mutations, mainly in ER- BC
  • PIK3CA (32.6%), GATA3(16.8%) and TP53 (16.8%) 这些突变也是年轻的多发于年长的
  • NTRK2 (5% vs.0%, p < 0.0001) and ARID1A (7% vs.2%, p = 0.03) 也是年轻的多发于年长的

 
下面是完整的教程重复这个分析 ！！！

肿瘤突变全景图如何画 https://mp.weixin.qq.com/s/6NNcftn9qsUrsxxl9XPZyQ

 

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