肿瘤基因列表

大家自己的课题如果聚焦到了某些基因,通常是想看看它们是否是肿瘤相关基因,比如肿瘤驱动基因,抑癌基因等等,这里主要是: oncoKBCCGlist
OncoKB Cancer Gene List OncoKB Cancer Gene List Cancer Gene List. 1039 genes
CG是一个肿瘤驱动基因的数据库,目前最新版本为v6.0, 网址如下

http://ncg.kcl.ac.uk/index.php
共收录了2372个驱动基因,分成以下两个部分

  1. 711 Known cancer genes
  2. 1661 Candidate cancer genes
    对于每个基因,提供了多种注释信息
    抑癌基因tumor suppressor gene,简称TSG,是一类存在于正常细胞内,可以抑制细胞生长并且具有潜在抑癌作用的基因。TSGene是一个从文献中收集整理的抑癌基因数据库,文章发表在Nucleic Acids Research,链接如下
    https://academic.oup.com/nar/article/41/D1/D970/1074154
    数据库的网址如下
    https://bioinfo.uth.edu/TSGene/
    最新版本为v2.0版本,共收录了1217个human TSGs, 其中包含1018个蛋白编码基因和199个lncRNA,同时对这些基因进行了多种注释,包括表达量,突变位点,蛋白相互作用等注释信息。

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