8个CRC病人的多位点取样单细胞转录组数据分析建议

每个病人 5个以上的样品,每个样品是 SMART-SEQ2测序,约100个细胞左右。

第一个分析,CNV

搜索一下对SMART-SEQ2测序数据做CNV分析,绘制如下CNV全景图。

第二个分析,SNV

转录组数据也是可以找SNV,可以看同一个病人的不同部位的SNV的相似性。(看重点的SNV)

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