我们生信技能树团队美女设计师在公众号发布了一个好玩的游戏,欢迎参与:https://mp.weixin.qq.com/s/h17jpmyqf-t1pFgjW78dHQ
早在四年前我建立生信技能树论坛时候,就架构好了一个生信工程师成长框架,对应着我们生信技能树论坛的各个板块,再次汇总一下:
生信基础
- 测序原理-数据格式-数据库,没有ngs就没有生物信息学
- 医疗相关应用,关系你的就业
- 生物学基础,主要是中心法则相关,分子生物学和细胞生物学
- 计算机基础 ,包括R,PYTHON, LINUX(SHELL)
- 统计学
- 可视化
当然,你也可以选择中国大学mooc进行基础知识补充: - 生信技能树分享了:中国大学MOOC的生物信息学公开课之河南科技大学 ,
- 生信菜鸟团分享了:中国大学MOOC的生物信息学之华中农业大学
以及最热门的:中国大学MOOC的生物信息学之山东大学互动作业
完成这项习题,才算是会编程。
- 脚本能力实践&公共资源下载&项目实战
在线应用
如果你实在是编程学起来有点困难,采用网页工具也无可厚非。
- 网页版工具
- 大分子表达量数据库&遗传变异资源数据库
组学大全
- 表观组
- 转录组&基因组
- 蛋白质组&微生物组&代谢组
现在是多组学时代,这些技术流程的视频教程好几年前我就全部免费共享在b站,如果你没有看,说明你可能并不值得培养,加入团队也很勉强。而且我同步分享了视频配套讲义和教辅材料; - 学徒第1月,基础知识介绍掌握:文档链接:https://mubu.com/doc/38tEycfrQg 密码:vl3q
- 学徒第2月,RNA-seq数据分析实战训练:文档链接:https://mubu.com/doc/38y7pmgzLg 密码:p6fo
- 学徒第3月,WES数据分析实战训练:文档链接:https://mubu.com/doc/1iDucLlG5g 密码:7uch
- 学徒第4月,ChIP-seq数据分析实战训练:文档链接:https://mubu.com/doc/11taEb9ZYg 密码:wk29
也为每个组学视频课程,设置了练习题,不知道大家是否有学习呢? - 学徒考核-计算wes数据的全部外显子的平均测序深度
- 肿瘤外显子视频课程小作业
- ChIPseq视频课程小作业
基本上每个过来我这边学习一个月以上的学徒我都会让他们学习多种组学(围绕着中心法则),而且有了Linux基础和R语言能力后, 跟着我们的视频教程很容易就学会基础流程,毫无压力。 - 给学徒ChIP-seq数据处理流程(附赠长达5小时的视频指导)
- 九月学徒ChIP-seq学习成果展(6万字总结)(上篇)
- 九月学徒ChIP-seq学习成果展(6万字总结)(下篇)
研究热点
四年前,我也没有想到,是单细胞领域火爆起来了。
- 研究热点版块介绍(一)
三代测序、化学信息学
免疫研究、GWAS
Meta分析、单细胞测序
进化分析、机器学习 - 研究热点版块介绍(二)
肿瘤信息学
- 研究热点版块介绍(三)
芯片处理
生信社区
- bioconductor中文&shiny交互网页
文末友情宣传
强烈建议你推荐给身边的博士后以及年轻生物学PI,多一点数据认知,让他们的科研上一个台阶:
- 全国巡讲全球听(买一得五) ,你的生物信息学入门课
- 生信技能树的2019年终总结 ,你的生物信息学成长宝藏
- 2020学习主旋律,B站74小时免费教学视频为你领路