高通量测序技术在肺癌领域的应用阅读

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昨天学徒推荐了一本书：《高通量测序技术在肺癌领域的应用》，觉得讲NGS应用实例挺好的，强烈要求我推荐给所有生信技能树的粉丝！

而且在微信读书APP里面可以免费浏览：https://weread.qq.com/web/reader/4df323307193c1ec4df6715

我看了一下，相见恨晚，花了半个小时赶紧看完了，收获颇多！里面的名词我基本上都认识，读起来超级亲切。强烈推荐所有的肿瘤学研究的硕博士都读一下，哪怕你不做肺癌研究，也不做NGS数据相关的课题。

而且我去搜索了一下，发现京东的数字内容里面，写着售价约20元，我实在是无法理解，为什么不同平台不同价格呢？微信读书这样的免费活动，不知道是否合规呢？

京东的数字内容版块售价20元

关于肺癌

肺癌是世界上发病率及死亡率最高的恶性肿瘤。我国75%的肺癌患者在诊断时已属晚期，5年生存率仅为仅为15%～16%。这种现状一方面与缺乏筛查有关，另一方面更与缺乏科学鉴别肺结节的方法有关。科学诊治肺结节，做好肺癌的早期诊断和早期治疗，是提高肺癌生存率、降低肺癌死亡率的重要措施。

肺癌分类

组织病理上通常将肺癌分为

  • 非小细胞肺癌（non-small-cell lung cancer，NSCLC）
  • 小细胞肺癌（small cell lung cancer，SCLC）

其中SCLC约占全部肺癌的15%~20%，SCLC的发病与吸烟密切相关，生物学特征为分化程度低、恶性程度高、倍增时间快、侵袭性强、预后差，中位生存期才7个月左右。

其中NSCLC又可以区分为LUSC和LUAD。

有一个网页工具文章的figure2，列出来了2015 WHO classification 的肺癌分类，From: LCE: an open web portal to explore gene expression and clinical associations in lung cancer

这本书到底好在哪里

首先，他是我目前看到的第一个也是唯一一个把NGS技术在肿瘤学领域的应用写成书的，其实就是不同ngs技术在肺癌的研究合辑，多个综述罢了，或者你可以这样理解，就相当于13个公众号推文的合辑。而且这个策略是可以完美嫁接到其它癌症研究领域，都是整理ngs技术在某个癌症的研究现状。

包括目前有多少WGS，WES，捕获测序的研究，样本量，多位点取样看肿瘤克隆进化和异质性。转录水平看癌症基因或者抑癌基因的表达失调情况，融合基因事件等等。当然，少不了大热的免疫治疗和肿瘤早筛啦，还有传说中的肠道菌群。

目录

第一章 高通量测序的概念和发展

  • 第一节 NGS的发展
  • 第二节 长读长的NGS测序
  • 第三节 NGS测序在临床和科研中的应用

    第二章 肺癌流行病学和靶向治疗

  • 第一节 肺癌的诊断
  • 第二节 肺癌的常见靶向治疗
  • 第三节 其他靶向治疗

    第三章 NGS在肺癌分子病理及其诊断决策中的应用

  • 第一节 NGS对肺癌分子病理学及诊断的检测分析
  • 第二节 临床应用对NGS检测的要求

    第四章 NGS研究肺癌异质性和肿瘤进化

  • 第一节 肿瘤异质性和肿瘤进化
  • 第二节 研究肺癌异质性及进化的意义

    第五章 NGS发现罕见突变基因

  • 第一节 肺腺癌罕见突变基因
  • 第二节 肺鳞癌罕见突变基因
  • 第三节 小细胞癌罕见突变基因
  • 第四节 香烟暴露与肺癌基因组改变

    第六章 NGS发现肺癌基因表达异常

  • 第一节 肺鳞癌基因表达异常
  • 第二节 肺腺癌基因表达异常
  • 第三节 小细胞肺癌基因表达异常

    第七章 NGS指导治疗决策和鉴定肿瘤耐药机制

  • 第一节 肺癌基因组学研究的主要内容及其临床意义
  • 第二节 NGS鉴定肺癌耐药机制
  • 第三节 NGS促进肺癌的研究和治疗
  • 附：NCCN关于NSCLC指导用药的参考

    第八章 NGS指导肺癌免疫治疗

  • 第一节 免疫治疗概述
  • 第二节 过继性T细胞治疗和CAR-T
  • 第三节 使用NGS助力肿瘤反应性T细胞鉴定肿瘤特异性抗原
  • 第四节 NGS指导免疫治疗

    第九章 NGS和cfDNA辅助肺癌诊断和治疗

  • 第一节 cfDNA的基本概念和特性
  • 第二节 cfDNA的NGS测序方法
  • 第三节 cfDNA突变检测技术
  • 第四节 cfDNA在肺癌领域的最新进展

    第十章 肺癌单细胞NGS测序的意义和进展

  • 第一节 单细胞测序方法
  • 第二节 单细胞测序的临床研究

    第十一章 人体微生物测序在肺癌诊疗中的研究和发展

  • 第一节 NGS和微生物研究
  • 第二节 肠道微生物、口腔微生物和肺部微生物
  • 第三节 微生物对肺癌发生和治疗的影响

    附录 经典病例

    关键词索引

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