EMBL-EBI生物信息学培训界领头羊

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早在3年前我就分享过：EMBL-EBI 持续十年提供免费的生物信息学培训，实际上当时仅仅是浏览了前面几个，错误的抽样调查得到错误的结论，并不是全部免费，他们机构提供一系列收费培训。包括小众的蛋白质组学和代谢组学。

2020年10月的单细胞转录组培训仅需300欧元

我昨天就迫不及待在单细胞天地跟大家分享了这个好消息：5天单细胞转录组培训仅需300欧元而且是包食宿哦 ，非常适合本来就在欧洲求学的粉丝！

普通转录组居然收费900欧元

这个推荐指数0颗星，但是我觉得他们的定位很清晰！

This course is aimed at advanced PhD students and post-doctoral researchers who are applying or planning to apply high throughput sequencing technologies and bioinformatics methods in their research.

同样的课程，我们生信技能树的爆款入门收费才不到他们的一半，强烈建议你推荐给身边的博士后以及年轻生物学PI，多一点数据认知，让他们的科研上一个台阶：

内容大同小异：

  • High-throughput sequencing technology
  • Quality control of raw reads: FASTQC and fastx toolkit
  • Considerations on experiment design for RNA-seq
  • Read pseudoalignment and quantification: kallisto, salmon
  • Differential expression analysis and differential exon usage: R, edgeR, DESeq2, DEXSeq
  • Downstream DE data processing and gene target discovery
  • Single cell RNA-seq analysis: scran, scater

这5天课程详细目录，大家自己浏览：https://www.ebi.ac.uk/training/events/2020/rna-sequence-analysis-0

基础蛋白生物学170欧元

看目录，都是一些数据库基础知识介绍：

  • Day 1: UniProtKB, InterPro, HMMER
  • Day 2: PDBe, EMDB, EMPIAR
  • Day 3: IntAct, Complex Portal, Reactome

具体课程表，大家自己浏览：https://www.ebi.ac.uk/training/events/2020/bioinformatics-resources-protein-biology-4

蛋白质组学就贵了一点，5天750欧元

内容也丰富很多：

  • Mass Spectrometry Basics
  • MS Search Engines and post-processing software
  • Quantitative proteomics
  • Protein sequence databases and their use
  • Protein sequence data in UniProt
  • Post-translational modifications
  • Standardisation of proteomics data
  • MS proteomics repositories and the ProteomeXchange consortium
  • PRIDE and PRIDE-related tools
  • Proteogenomics
  • Protein interaction data through IntAct and the IMEX consortium
  • Functional analysis of proteins using Cytoscape
  • Placing proteins in pathways using Reactome

具体课程表，大家自己浏览：https://www.ebi.ac.uk/training/events/2020/proteomics-bioinformatics-4

目前我们生信技能树并没有蛋白质组学的视频教程，只有一个学习小组，和10个推文教程，如下：

代谢组学4天课程590欧元

因为确实一直没有接触过，所以也不知道如何介绍它，目录如下：

  • Fundamentals of metabolomics experimental design
  • Basic concepts of metabolomics data analysis
  • Availability of opensource tools available for metabolomics data analysis
  • How to combine tools to create an analysis workflow

具体课程表，大家自己浏览：https://www.ebi.ac.uk/training/events/2020/introduction-metabolomics-analysis-1

十年无数课程

详见：https://www.ebi.ac.uk/training/10-years

文末友情宣传

强烈建议你推荐给身边的博士后以及年轻生物学PI，多一点数据认知，让他们的科研上一个台阶：

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