R包各大镜像纷纷宕机

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本来以为是写了：【紧急通知】下载R包却联网失败？初学者的痛，大家应该是不再发邮件咨询我R包安装问题，没想到的是碰到了R包各大镜像纷纷宕机！

![镜像站点故障]http://www.bio-info-trainee.com/wp-content/uploads/2020/04/image-20200417103009469.png)

这个对初学者来说，的确很难理解，如果你参加学习班的话，就有讲师和助教团队协助解决了（感兴趣的可以点击下面两个课程）：

不过绝大部分（99.99%）的粉丝无缘我们学习班，我只能是通过公众号的方式告知大家这个解决方案了。如果安装R包失败，提示Warning: unable to access index for repository …cannot open URL….请尝试这种方法：

options(BioC_mirror="http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/bioconductor/")
options("repos" = c(CRAN="http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))
BiocManager::install("包")
install.packages('包')

可以看到，主要的修改方式，在于镜像地点，还有https和http协议切换。

关于R镜像列表

R语言在中国区的镜像不多，大家可以在 https://cran.r-project.org/mirrors.html 查询，列表如下：

https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/ TUNA Team, Tsinghua University
https://mirrors.ustc.edu.cn/CRAN/ University of Science and Technology of China
https://mirror-hk.koddos.net/CRAN/ KoDDoS in Hong Kong
https://mirrors.e-ducation.cn/CRAN/ Elite Education
https://mirror.lzu.edu.cn/CRAN/ Lanzhou University Open Source Society
https://mirrors.tongji.edu.cn/CRAN/ Tongji University

如果失败，或者网速不好，就替换一下即可。

options()$repos 
options()$BioC_mirror

替换后进行简单的检查！

关于https和http协议

纯粹是增加我们的认知负担，不建议大家去学习了，如果你感兴趣，可以看：Windows电脑使用Rstudio会有多少错误呢 ，下面的两个代码也会对你有帮助。

options(download.file.method = 'libcurl')
options(url.method='libcurl')

还有就是，不要害怕这样的代码，运行前后看看效果就好了，重启R这些设置都会失效，不会对你电脑造成永久性损伤！

更无语的是还有一些人使用bioclite在安装R包

今早就接到一个四年前的微信好友，也许是生信菜鸟团qq群认识的，问出R包安装的问题

![image-20200417104631955]http://www.bio-info-trainee.com/wp-content/uploads/2020/04/image-20200417104631955.png)

真的是很过分了，这些年我写了1.3万篇教程，约10%都是与R相关的，关于r全套资料我早就分享完毕了：
很多朋友之所以学习R语言其实就是为了重复一些简单的数据库挖掘文章，所以我也顺便录制了GEO数据库挖掘课程，代码在：https://github.com/jmzeng1314/geo，如果你网络很差，就下载打包版本的geo代码，https://share.weiyun.com/5vrfsqv

并且一定要做作业，比如https://mp.weixin.qq.com/s/4VP8fK5rTRW9aiJwYFxzNw
配套教学视频在B站：https://www.bilibili.com/video/av26731585/
还有一个公共数据库挖掘：https://www.bilibili.com/video/av37568990
视频应该是都在：https://www.bilibili.com/video/av25643438/

如果是需要安装R包，请务必参考：http://www.bio-info-trainee.com/3727.html 代码
专门为R语言建立了 GitHub 仓库存放相关学习路线指导资料：https://github.com/jmzeng1314/R_bilibili

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