文章数据分析流程图如下：
如果你有R代码基础，那么你可能需要阅读我在生信技能树的甲基化教程列表：
- 01-甲基化的一些基础知识.pdf
- 02-甲基化芯片的一般分析流程.pdf
- 03-甲基化芯片数据下载的多种技巧.pdf
- 04-甲基化芯片数据下载如何读入到R里面.pdf
- 05-甲基化芯片数据的一些质控指标.pdf
- 06-甲基化信号值矩阵差异分析哪家强.pdf
- 07-甲基化芯片信号值矩阵差异分析的标准代码.pdf
- 08-TCGA数据库的各个癌症甲基化芯片数据重新分析.pdf
- 09-TCGA数据库的癌症甲基化芯片数据重分析.pdf
- 10-TCGA数据辅助甲基化区域的功能研究.pdf
- 11-按基因在染色体上的顺序画差异甲基化热图.pdf
- 850K甲基化芯片数据的分析.pdf
- 使用DSS包多种方式检验差异甲基化信号区域.pdf
或者去看我B站免费视频课程《甲基化芯片（450K或者850K）数据处理 》在B站免费视频课程
甲基化芯片（450K或者850K）数据处理
- 教学视频免费在：https://www.bilibili.com/video/BV177411U7oj
- 课程配套思维导图：https://mubu.com/doc/1cwlFgcXMg
- 甲基化芯片相关资料，https://share.weiyun.com/42a9e78c2dd5367f3427e86c5c99baa1 按需下载，不要整个文件夹全部下载
- 表观全部资料，https://share.weiyun.com/5tg6pIn 同样是按需下载，不要整个文件夹全部下载
往期学徒作业列表：
- 1.Nanostring的表达矩阵分析也是大同小异
- 2.Agilent芯片表达矩阵处理(学徒作业)
- 3.上次说的gmt函数(学徒作业)
- 4.谁说肿瘤高表达基因就是生存风险因子（学徒作业）
- 5.学徒作业：给你8个甲基化探针， 你在tcga数据库进行任意探索
- 6.学徒作业-我想看为什么这几个基因的表达量相关性非常高
- 7.学徒作业-两个基因突变联合看生存效应
- 8.学徒作业-指定基因在指定组织里面的表达量热图