我这七年写了几万篇教程,制作了几百个小时的教学实战演练视频课程,都是免费分享在各大网站(B站,知乎,简书,博客,GitHub,微云),必然会出现部分教程过时,一些资料缺失(主要是链接失效)。而且很多平台都是生信技能树的各个志愿者帮忙打理,我不可能要求大家伙在辛辛苦苦帮我整理和发布资料的同时还提供答疑。比如这几天在登陆b站,就看到了这两年来积累的“铺天盖地的”留言和私信,我已经在:免费视频课程《RNA-seq数据分析》交流群组建通知 列出来了。其它交流群见:
我非常能理解,大家想急切跟我交流的心情,其实就是初学者心态,七年前我也是这样过来的。但是我的时间和精力确实是有限的,很多事情我只能是雇人来做!接下来我会组建15个B站NGS组学答疑微信群,老规矩,需要18.8的入群费用,里面的群公告会及时更新课程相关资料,主要是云盘链接总是被坏人举报,太多的好资料需要更新。也会有一些答疑视频互动,以及对应的答疑推文。
今天,我们带来的是甲基化芯片数据分析-B站免费课程交流群。
我们所有的群都是由生信技能树的官方拉群小助手操作,大家在应该是多次看到了:
课程学习路线图
首先需要阅读我在生信技能树的甲基化系列教程,目录如下:
- 01-甲基化的一些基础知识.pdf
- 02-甲基化芯片的一般分析流程.pdf
- 03-甲基化芯片数据下载的多种技巧.pdf
- 04-甲基化芯片数据下载如何读入到R里面.pdf
- 05-甲基化芯片数据的一些质控指标.pdf
- 06-甲基化信号值矩阵差异分析哪家强.pdf
- 07-甲基化芯片信号值矩阵差异分析的标准代码.pdf (微信交流群在这里)
- 08-TCGA数据库的各个癌症甲基化芯片数据重新分析.pdf
- 09-TCGA数据库的癌症甲基化芯片数据重分析.pdf
- 10-TCGA数据辅助甲基化区域的功能研究.pdf
- 11-按基因在染色体上的顺序画差异甲基化热图.pdf
- 850K甲基化芯片数据的分析.pdf
- 使用DSS包多种方式检验差异甲基化信号区域.pdf
然后就可以看我在B站免费分享的视频课程《甲基化芯片(450K或者850K)数据处理 》
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课程配套思维导图:https://mubu.com/doc/1cwlFgcXMg
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甲基化芯片相关资料,https://share.weiyun.com/42a9e78c2dd5367f3427e86c5c99baa1 按需下载,无需整个文件夹全部下载
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表观全部资料,https://share.weiyun.com/5tg6pIn 同样是按需下载,无需整个文件夹全部下载
当然需要读者具备计算机基础知识,我把它粗略的分成基于R语言的统计可视化,以及基于Linux的NGS数据处理:
其中,对甲基化芯片数据处理实战来说,R更重要一点,我把R的知识点路线图搞定,如下:
- 了解常量和变量概念
- 加减乘除等运算(计算器)
- 多种数据类型(数值,字符,逻辑,因子)
- 多种数据结构(向量,矩阵,数组,数据框,列表)
- 文件读取和写出
- 简单统计可视化
- 无限量函数学习
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