关于机器学习,在肿瘤数据库挖掘里面,主要是生存模型构建最广泛。比如我在B站免费共享TCGA肿瘤数据库知识图谱视频教程中共使用了四种算法构建模型(都是R语言实现):
- cox(可做单因素和多因素)
TCGA的cox模型构建和风险森林图 - lasso回归
用lasso回归构建生存模型+ROC曲线绘制 - 随机森林
听起来很霸气用起来并不难的随机森林 - 支持向量机
听起来很霸气用起来并不难的 支持向量机
不管用了那种算法,核心都只是几句R代码而已,如果不细致探索原理,其实简单的一个R包或者函数即可。生信菜鸟团的《周日-鲍志炜专栏》
如果是是python呢,我们生信菜鸟团的《周日-鲍志炜专栏》也有一个机器学习系列教程,目录如下:
- Jupyter Notebook 你不得不知的交互式笔记本
- 我最常用的 10 个 Jupyter Notebook 插件
- 免费的在线 Jupyter Notebook
- 机器学习实战 | 数据预处理
- 机器学习实战 | 特征选择
- 机器学习实战 | k-邻近算法
- 机器学习实战 | 决策树
- 机器学习实战 | 朴素贝叶斯
- 机器学习实战 | 逻辑回归
- 机器学习实战 | 支持向量机
- 机器学习实战 | 支持向量机·sklearn 参数详解
- 机器学习实战 | Adaboost
- 机器学习实战 | 机器学习性能指标
- 用小样本数据集进行机器学习建模的一些建议
- 用 Scikit-learn Pipeline 创建机器学习流程
- sklearn 模型的保存与加载
关于深度学习,我看到一个CSDN博客地址 https://michael.blog.csdn.net/最近在做一些知识整理,他的公众号排版也很漂亮,值得推荐:吴恩达 -《深度学习DeepLearning》汇总目录
01.神经网络和深度学习
W1.深度学习概论
W2.神经网络基础
- 01W2 作业 - 逻辑回归 图片识别
W3.浅层神经网络
- 01W3 作业 - 带一个隐藏层的神经网络
W4.深层神经网络
- 01W4 作业 - 建立你的深度神经网络+图片猫预测
02.改善深层神经网络:超参数调试、正则化以及优化
W1.深度学习的实践层面
- 02W1 作业 - 初始化+正则化+梯度检验
W2.优化算法
- 02W2 作业 - 优化方法
W3.超参数调试、Batch Norm和程序框架
- 02W3 作业 - TensorFlow教程+数字手势预测
再多的资料也不可能代替大家学习
每次我们组建交流群,大家都喜欢共享一大堆的百度云,微云资料,几百个G的视频和代码,真的是太可怕了。基本上都是咸鱼购买的,有松鼠症,希望收集:
其实真心没有意义,学习最重要的是付出时间和精力,然后有项目驱动,你首先得有需求,然后学习起来才会快乐。在这里,我们依托于生信技能树平台,希望把有需求的小伙伴集合起来,一起来聊聊学习经验,互相补充百度云微信视频资料。我们所有的群都是由生信技能树的官方拉群小助手操作,大家在应该是多次看到了: - 一个甲基化芯片信号值矩阵差异分析的标准代码
- 购买入门级服务器免费送Linux直播培训服务
- lncRNA-seq数据分析之新lncRNA鉴定和注释视频课程众筹
交流群抽奖
加入交流群,不仅仅是可以拿到各路好友共享的资料,以及得到天南海北同道中人的帮助和鼓励,还有一个简单的抽奖。
大家都知道,我们生信技能树每个月都会收到图灵出版社的10本书籍,其中5本会拿出来赠送给粉丝。那么我们九月份就选择这本书哈:《机器学习实战》,其中交流群里面抽奖赠送3本,然后本推文文末留言点赞前两名(9月13号这周日晚上八点截止)也各自获得一本赠书哦!
文末友情推荐
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