免费视频课程-TCGA数据库分析实战

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我这七年写了几万篇教程，制作了几百个小时的教学实战演练视频课程，都是免费分享在各大网站（B站，知乎，简书，博客，GitHub，微云），必然会出现部分教程过时，一些资料缺失（主要是链接失效）。而且很多平台都是生信技能树的各个志愿者帮忙打理，我不可能要求志愿者们在辛辛苦苦帮我整理和发布资料的同时还提供答疑。

我非常能理解，大家想急切跟我交流的心情，其实就是初学者心态，七年前我也是这样过来的。但是我的时间和精力确实是有限的，很多事情我只能是雇人来做！接下来我会组建15个B站NGS组学答疑微信群，老规矩，需要18.8的入群费用，里面的群公告会及时更新课程相关资料，主要是云盘链接总是被坏人举报，太多的好资料需要更新。也会有一些答疑视频互动，以及对应的答疑推文。

今天，我们带来的是TCGA数据库分析实战-B站免费课程交流群。

我们所有的群都是由生信技能树的官方拉群小助手操作，大家在应该是多次看到了：

也成功的组建了分门别类的学习交流群，如下：

我喜欢把TCGA数据库的应用划分为8个领域：

  • 1、探索各类肿瘤不同临床特征（性别、年龄、种族、临床分期）的预后（生存曲线）
  • 2、探索各类肿瘤与对照的单个分子（mRNA，lncRNA，miRNA，甲基化，蛋白）水平的差异情况（箱线图）
  • 3、探索各类肿瘤与对照的全局（mRNA，lncRNA，miRNA，甲基化，蛋白）水平的差异情况（差异分析流程）
  • 4、探索各类肿瘤中两个分子（mRNA，lncRNA，miRNA，甲基化，蛋白）水平相关性（散点图）
  • 5、探索各类肿瘤中多个分子（mRNA，lncRNA，miRNA，甲基化，蛋白）水平总结（热图）
  • 6、探索各类肿瘤中单个分子（mRNA，lncRNA，miRNA，甲基化，蛋白）与所有其它分子相关性并且排序
  • 7、探索各类肿瘤中单个基因突变或者单个分子（mRNA，lncRNA，miRNA，甲基化，蛋白）水平的预后（生存曲线）
  • 8、探索各类肿瘤不同临床特征（性别、年龄、种族、临床分期）分组后的单个分子（mRNA，lncRNA，miRNA，甲基化，蛋白）特性的分布

希望大家多交流最新TCGA数据应用，最新文献，最新技术哦！我的视频，仅仅是一个抛砖引玉哈

视频观看方式

视频目录

关于TCGA数据挖掘，大多数需求其实也就是差异和相关性，生存分析等等，我们的视频目录如下：

  • P1-TCGA-101-课程介绍-需要哪些背景知识
  • P2-TCGA-102-课程导读-如何使用我的github代码
  • P3-TCGA-103—TCGA数据库大有作用-不仅仅是灌水
  • P4-TCGA-201-背景介绍及网页工具大全
  • P5-TCGA-202-其它数据库介绍
  • P6-TCGA-203-使用Xena网页工具
  • P7-TCGA-204-使用firehose网页工具
  • P8-TCGA-205-文章规律讲解
  • P9-TCGA-301-数据下载方式导言
  • P10-TCGA-302-GDC下载数据实战
  • P11-TCGA-303-GDC数据整理
  • P12-TCGA-304-GDC下载数据续集
  • P13-TCGA-305-R-TCGA包下载数据及数据提取
  • P14-TCGA-306-使用GDC和firehose下载-TCGA的胃癌的甲基化信息数据
  • P15-TCGA-307-使用GDC和Xena下载RNA-Seq的表达矩阵并且比较

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