CoMutPlotter这个网页工具与2019年7月发表在 BMC Medical Genomics 杂志,文章标题是;《CoMutPlotter: a web tool for visual summary of mutations in cancer cohorts》选自第八届转化生物信息学会议: 医学基因组学,研究者是台湾长庚大学的。
我以前介绍过他们团队的台湾口腔癌多组学队列研究。详见:台湾OSCC癌症多组学| 生信菜鸟团,2016年10月年发表在NC:APOBEC3A is an oral cancer prognostic biomarker in Taiwanese carriers of an APOBEC deletion polymorphism,我相信他们也应该是踩了很多坑,才决心制作一个网页工具吧!
参考:http://tardis.cgu.edu.tw/comutplotter/comutplotter_tutorial/
值得一提的是:他们使用 bookdown 来制作网页工具文档的思路很棒,值得学习!
1 Introduction
2 Implementation
2.1 CoMutPlotter Framework
2.2 Data Input
2.3 Visualization and web modules
2.4 OUTPUT
3 Example of Use
3.1 Upload mutation profile
3.2 Output of CoMutPlotter
3.3 Cross-project comparison
3.4 Download & Report Generation
Published with bookdown
点击文末阅读原文就可以直达网页工具文档哦!
关于突变全景图的知识点,大家可以看我在《生信技能树》的教程啦,如果你目前看教程比较困难,有一个学习班推荐给大家!