前段时间,腾讯的云+社区找到了我,纯粹的技术交流渠道,认可我在大数据方向孜孜不倦的创造。希望我尝试一下他们的新功能:《阅读清单》,有点类似于专辑。因为这七八年我写了1.3万篇教程,很多都是零零散散的笔记,但也有不少是成系统的,估摸着有500多个专辑,全部整理起来工作量太大了。为了应付这个《阅读清单》评审工作,我从500多个专辑里面精选了这3个参加评选,希望《生信技能树》的粉丝们能支持我!
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NGS图表复现
目录如下:
- CNS图表复现01—读入csv文件的表达矩阵构建Seurat对象
- CNS图表复现02—Seurat标准流程之聚类分群
- CNS图表复现03—单细胞区分免疫细胞和肿瘤细胞
- CNS图表复现04—单细胞聚类分群的resolution参数问题
- CNS图表复现05—免疫细胞亚群再分类
- CNS图表复现06—根据CellMarker网站进行人工校验免疫细胞亚群
- CNS图表复现07—原来这篇文章有两个单细胞表达矩阵
- CNS图表复现08—肿瘤单细胞数据第一次分群通用规则
- CNS图表复现09—上皮细胞可以区分为恶性与否
- CNS图表复现10—表达矩阵是如何得到的
- CNS图表复现11—RNA-seq数据可不只是表达量矩阵结果
- CNS图表复现12—检查原文的细胞亚群的标记基因
- CNS图表复现13—使用inferCNV来区分肿瘤细胞的恶性与否
- CNS图表复现14—检查文献的inferCNV流程
- CNS图表复现15—inferCNV流程输入数据差异大揭秘
- CNS图表复现16—inferCNV结果解读及利用
- CNS图表复现17—inferCNV结果解读及利用之进阶
cytof数据分析
目录如下:
- 1.cytof数据资源介绍(文末有交流群)
- 2.cytofWorkflow之读入FCS文件(一)
- 3.cytofWorkflow之构建SingleCellExperiment对象(二)
- 4.cytofWorkflow之基本质量控制(三)
- 5.cytofWorkflow之聚类分群(四)
- 6.cytofWorkflow之人工注释生物学亚群(五)
- 7.cytofWorkflow之亚群比例差异分析(六)