我太喜欢微信公众号的专辑这个功能了,帮我把2020在《生信技能树》公众号发布的300多篇生物信息学笔记很方便的串联起来了。但蓦然回首,赫然发现这个2020我居然真的并没有学习什么新知识,但是不管怎么说,坚持下来了,就还不差了。做生物信息学笔记分享的这七年,见过了太多优秀的公众号销声敛迹,能活着就值得敬佩!
虽然我被腾讯的云+社区邀请参加他们的年终盛典这个引以为傲的成就,关注着也寥寥无几,见:感谢粉丝的5星大力支持,我被腾讯的云+社区邀请参加他们的年终盛典,可能是大家已经留意到了我的江郎才尽?
完全是在炒三年前的冷饭
首先是把三年前B站的视频课程给分门别类的组织了微信群聊,督促大家学习。因为疫情嘛,绝大部分生命科学领域从业者都没办法进入实验室,被隔离在家的日子了,抄起电脑干起数据分析才是自救之路,所以有 了十余个微信交流群,包括下面这些:
- 免费视频课程《RNA-seq数据分析》
- 免费视频课程《WES数据分析》
- 免费视频课程《ChIP-seq数据分析》
- 免费视频课程《ATAC-seq数据分析》
- 免费视频课程《TCGA数据库分析实战》
- 免费视频课程《甲基化芯片数据分析》
- 免费视频课程《影像组学教学》
- 免费视频课程《LncRNA-seq数据》
- 免费视频课程《GEO数据挖掘》
- 肿瘤基因测序
虽然是在炒三年前的冷饭,但是对绝大部分在2020才关注到我们《生信技能树》公众号粉丝来说,仍然是全新的内容啦,毕竟入门指导才是刚需,每个人都得自己跌跌撞撞的学习基本知识和技能。写的比较好的专辑
微信公众号的专辑这个功能很棒,以后就不需要劳心劳力的整理目录,大家点进去下面任何一个推文,都可以看到跟内容相关的全部专辑的其它笔记哦:
生存分析目录精选: - apply家族函数和for循环还是有区别的(批量生存分析出图bug)
- TCGA数据库生存分析的网页工具哪家强
- KM生存曲线经logRNA检验后也可以计算HR值
甲基化目录精选: - 01-甲基化的一些基础知识.pdf
- 02-甲基化芯片的一般分析流程.pdf
- 03-甲基化芯片数据下载的多种技巧.pdf
学徒作业目录精选: - 1.Nanostring的表达矩阵分析也是大同小异
- 2.Agilent芯片表达矩阵处理(学徒作业)
- 3.上次说的gmt函数(学徒作业)
- 4.谁说肿瘤高表达基因就是生存风险因子(学徒作业)
- 5.学徒作业:给你8个甲基化探针, 你在tcga数据库进行任意探索
- 6.学徒作业-我想看为什么这几个基因的表达量相关性非常高
- 7.学徒作业-两个基因突变联合看生存效应
- 8.学徒作业-指定基因在指定组织里面的表达量热图
cytof数据分析目录精选: - 1.cytof数据资源介绍(文末有交流群)
- 2.cytofWorkflow之读入FCS文件(一)
- 3.cytofWorkflow之构建SingleCellExperiment对象(二)
- 4.cytofWorkflow之基本质量控制(三)
- 5.cytofWorkflow之聚类分群(四)
- 6.cytofWorkflow之人工注释生物学亚群(五)
- 7.cytofWorkflow之亚群比例差异分析(六)
CNS图表复现专题精选: - CNS图表复现01—读入csv文件的表达矩阵构建Seurat对象
- CNS图表复现02—Seurat标准流程之聚类分群
- CNS图表复现03—单细胞区分免疫细胞和肿瘤细胞
- CNS图表复现04—单细胞聚类分群的resolution参数问题
- CNS图表复现05—免疫细胞亚群再分类
- CNS图表复现06—根据CellMarker网站进行人工校验免疫细胞亚群
还抽空培养了一下后起之秀
2020暑假前的优秀本科生数据挖掘毕业设计课题辅导活动, 已经带领了近100多名优秀本科毕生了解生物信息学,并且完成了相关毕业设计,见:这120万我就不要了,送给500名优秀本科生,以及后面的:优秀本科生夏令营辅导群。
在人才梯队建设方面,我还是下了一些苦功夫的,希望十年后能开花结果吧!然后引导学生们举办十余场钉钉群的公开课
在布置学徒作业的过程中,发现了一些好的苗子,他们完成作业的节奏把握的非常好,文档条理清楚,思维逻辑比较缜密,所以我尝试邀请其中一些优秀学徒开启自己的直播互动授课,体验不一样的人生。当然了,失败率很高,邀请了三十多个学徒,只有5个人愿意追随我的脚步。
有一些课程在钉钉群: - WGCNA-流程及原理细节直播互动授课5928729
- 生存分析速成指南,赶紧收藏!5371384
- ID转换靠的是深厚的背景知识加上一点代码技巧5371384
- R语言公益课程之bioconductor2524659
- 转录组公益课(含单细胞)(名额有限,先到先得)1064154
- 还有我们团队新晋讲师卖萌哥主讲的:Linux公益课之2021
有一些课程以微信群聊的方式组织起来了: - 单细胞数据挖掘基础
- R语言统计可视化
- 单细胞数据分析进阶
有一些课程还在研发中 - 学徒数据挖掘之2018
- 学徒数据挖掘之2019
- ATAC-seq实战
其实早在三五年前我就都有了成套的视频课程,但毕竟有一些知识点会过时,所以就挖掘了一些新人,让他们重新学习我的课程但是呢依据自己的理解把我的课程重构,给大家带来不一样的体验。团队协作坚持了一整年的两个官方学习班
我在《生信技能树》发布的 我应该不需要你来教我如何赚钱 吐槽小短文里面提到了,我们的学习班对绝大部分(99.9%)粉丝来说是不需要的,因为我已经共享了100个小时的生信工程师数据分析视频免费在B站,但是仍然是有两三百个有经费,负基础的朋友是需要手把手指导的,这可能是市面上为数不多的良心学习班啦:
- 数据挖掘(GEO,TCGA,单细胞)第10期(今年最后一期)
- 生信 爆款入门-第12期(今年最后一期)
反响良好,团队成员干的也有成就感,所以坚持下去就是顺理成章的事情啦,希望明年可以开启线下到达学生们的城市做到真正的手把手教学!生物信息学入门(4周马拉松式授课)
这个入门课程算得上是历史悠久啦,毕竟是走南闯北跨越了30多个城市, 带领了近500来自于全国各大高校科研院所硕博士认识我们的生物信息学。在入门内容的反复锤炼上,我们升级了授课材料和代码以及配套的Linux服务器。
数据挖掘(3周马拉松式授课)
我们生信技能树的王牌讲师小洁作为该课程的主理人,撑起来了半边天,每个月都有三周需要把时间和精力花在各种零基础负基础学员上面,苦口婆心传授学习方法和技巧,还得时不时的灌鸡汤,避免大家畏难情绪占上风,真不容易啊!
距离我的十年退休之约还有3年
不知不觉就坚持了近7年笔耕不辍的分享自己在生物信息学技术进展的点点滴滴,老实说,确实厌倦了,所以给了自己一个10年这样的期限,逼自己一把。微信公众号的每日一更这样的机制确实成就了我,帮我带来了十万粉丝,不同的人在不同时间打开我们公众号都会有新鲜笔记,新的知识点可以吸收。但同时也限制了我,我不得不耗费大量的时间去思考第二天该更新什么呢,第三天,甚至一个星期后?
再坚持3年,我要把《生信技能树》公众号打造成为我的优秀学生们的舞台,我退居幕后,当然偶有灵感也会写一下笔记,但不再是被微信公众号的每日一更机制逼着走的机械式的输出。
非常期待我放下十万粉丝后的自由!