Y叔神包clusterProfiler更新到4啦(大家一起来写包吧)

看到Y叔的公众号发出了:Published:July 01, 2021

  • DOI:https://doi.org/10.1016/j.xinn.2021.100141
    把论文写在祖国大地上,clusterProfiler 4.0发表在中科院青促会主办的期刊The Innovation,可以引用了!
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    原来是clusterProfiler更新到4啦,我没有具体看到底更新了什么,不过Y叔本来就特意为其包写了一本书来介绍其用法,其中网络在线书籍《clusterProfiler: universal enrichment tool for functional and comparative study》的 Chapter 12 Visualization of Functional Enrichment Result ,链接是:http://yulab-smu.top/clusterProfiler-book/chapter12.html

    1 Bar Plot
    2 Dot plot
    3 Gene-Concept Network
    4 Heatmap-like functional classification
    5 Enrichment Map
    6 UpSet Plot
    7 ridgeline plot for expression distribution of GSEA result
    8 running score and preranked list of GSEA result
    9 pubmed trend of enriched terms
    10 goplot
    11 browseKEGG
    12 pathview from pathview package
    

    你最喜欢哪一种可视化方法呢?如果你还没有看过这些可视化方法,那么网络在线书籍《clusterProfiler: universal enrichment tool for functional and comparative study》你一定不要错过哦,至少可以补充很多基础知识。
    另外一个也写成了网络在线书籍的是,https://jokergoo.github.io/ComplexHeatmap-reference/book/

    如果你还不知道Y叔是谁

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    授课大纲是:https://share.mubu.com/doc/340uM6oDyQ3
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