看到Y叔的公众号发出了:Published:July 01, 2021
- DOI:https://doi.org/10.1016/j.xinn.2021.100141
把论文写在祖国大地上,clusterProfiler 4.0发表在中科院青促会主办的期刊The Innovation,可以引用了!
原来是clusterProfiler更新到4啦,我没有具体看到底更新了什么,不过Y叔本来就特意为其包写了一本书来介绍其用法,其中网络在线书籍《clusterProfiler: universal enrichment tool for functional and comparative study》的 Chapter 12 Visualization of Functional Enrichment Result ,链接是:http://yulab-smu.top/clusterProfiler-book/chapter12.html1 Bar Plot 2 Dot plot 3 Gene-Concept Network 4 Heatmap-like functional classification 5 Enrichment Map 6 UpSet Plot 7 ridgeline plot for expression distribution of GSEA result 8 running score and preranked list of GSEA result 9 pubmed trend of enriched terms 10 goplot 11 browseKEGG 12 pathview from pathview package
你最喜欢哪一种可视化方法呢?如果你还没有看过这些可视化方法,那么网络在线书籍《clusterProfiler: universal enrichment tool for functional and comparative study》你一定不要错过哦,至少可以补充很多基础知识。
另外一个也写成了网络在线书籍的是,https://jokergoo.github.io/ComplexHeatmap-reference/book/如果你还不知道Y叔是谁
南方医科大学教授博导,看他的招博士通知吧:常年招硕博士、博士后一起搞生信或被生信搞
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