最近有小伙伴抱怨自己硕士毕业后入职某国内本土药企，但是工作内容仍然是高校培养事情的文章撰写，而且居然要求还降低了，之前还被导师压榨着要出英文SCI，现在公司仅仅是要求一堆凑数的中文文章即可，还有一大堆莫名其妙的专利申请。
因为这个小伙伴在还在本科大四时候就跟着我们生信技能树在学习生物信息学了，还参加过几次分享，所以就多聊了聊。确实对该学生来说，落差有点大，本来以为自己学的一身本领应该是出社会了大展拳脚，结果做的都是老生常谈的面子工程课题。
我让学生发了几个他们的目标文献给我看看：

摘 要：目的 探索小儿肺热咳喘颗粒抗冠状病毒的潜在作用机制。
方法 在TCMIP数据库中查找小儿肺热咳喘颗粒的各药材-成分-靶点信息，同时检索全方的候选靶基因，在Genecards数据库中以“coronavirus”为关键词搜索冠状病毒相关靶点，与小儿肺热咳喘颗粒全方活性靶点映射筛选出共同靶点作为研究靶点。将筛选出的共同靶点在已经总结的各药材-成分-靶点数据库中查找到对应的成分及所属药材。将共同靶点导入STRING数据库中构建靶点相互作用网络图，利用Cytoscape 3.3.0软件进行可视化处理，筛选出核心靶点。借助OmicsBean分析平台与STRING数据库对靶点进行基因本体（geneontology，GO）分析和KEGG信号通路富集分析。结果 总结得到小儿肺热咳喘颗粒342个化学成分，全方靶基因共有737个。Venny映射后的共同靶点48个，对应173个化合物，核心靶点19个，主要化合物27个。GO生物过程（BP）条目3 420个，细胞组成（CC）条目239个，分子功能（MF）条目343个。KEGG富集分析得到与小儿肺热咳喘颗粒治疗作用相关的信号通路160条。构建了小儿肺热咳喘颗粒核心靶点的“药材-成分-靶点-通路”网络。结论 173个化合物可通过作用于48个相关靶点，干预160条信号通路，如IL-17信号通路、甲型流感等，主要涉及抗炎、免疫调节、镇咳平喘、抗菌、抗病毒、镇静等方面，为小儿肺热咳喘颗粒治疗冠状病毒相关疾病提供理论依据。
参考文献
来 源：周稼荣，陈金鹏，刘 毅，刘素香，田成旺，陈常青，刘全国．基于网络药理学的小儿肺热咳喘颗粒抗冠状病毒作用机制探讨 [J]. 中草药, 2020, 51(15):3952-3959.
基于网络药理学和设计空间的乳腺康提取工艺研究 [J]. 中草药, 2021, 52(6):1634 -1644 .

原来就是传说中的《网络药理学》，其实这个方向也是部分英文SCI重灾区，不仅仅是中文文章，我随便搜索了一下，可以看到 2020年7月发表在Scientific Reports杂志的文章《基于网络药理学的茵栀黄颗粒治疗乙型肝炎作用机制》，原英文标题是：《A bioinformatics investigation into molecular mechanism of Yinzhihuang granules for treating hepatitis B by network pharmacology and molecular docking verification》，链接是；https://www.nature.com/articles/s41598-020-68224-7 ， 从流程图很容易看出来，这样的文章的套路：

就是各式各样的数据库检索而已，比如通过检索中药系统药理数据库TCMSP（http://tcmspw.com/tcmsp.php）、PubChem数据库（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/）、Pharm Mapper 数据库（http://lilab.ecust.edu.cn/ pharmmapper/index.php）查找5个活性成分的作用靶点；通过Uniprot数据库（http://www.uniprot.org/）将预测出的靶点名称转换为对应的基因名。将各数据库筛选出的靶点合并，除去重复靶点，最终得到与5个活性成分相关的75个靶点；
然后进行基因的注释而已，只不过呢，我们的geo数据库挖掘通常是差异分析等策略把基因数量弄小，而这个《网络药理学》是查询数据库的方式。
有意思的是：《中草药》杂志是中国最著名的中医药期刊之一，荣获中国新闻出版行业最高奖一一中国出版政府奖，中国期刊界
类似的杂志还有《现代药物与临床,》，比如其2021年的文章《基于网络药理学和分子对接方法探讨雷公藤对狼疮性肾炎的效毒作用机制》 ，也是通过各自数据库查询狼疮性肾炎的疾病基因与雷公藤主要活性成分所对应的候选靶标基因，然后利用R语言的VennDiagram函数将两个靶基因取交集，获取共有基因作为雷公藤治疗狼疮性肾炎的潜在作用靶标。接着进行go和kegg等数据库注释而已。

中草药数据库也不少了，比如ETCM数据库

• （Encyclopedia ofTraditional Chinese Medicine）
• 主页（http://www.tcmip.cn/ETCM/index.php/Home/）
  2019年发表在Nucleic Acids Res杂志，目前收录402种中草药、3959个中药配方、7284种有效成分及经实验验证或预测的2266个基因靶标和对应的4323种疾病相关数据。

  我也不知道如何安慰这个学生

  其实绝大部分社会上的知识分子的工作，就是讲故事而已，又不是小本生意看到的买卖，有流水有事实。社会分工的精细化企业的复杂性远超于我们初出茅庐的应届生所能把握的， 也许你现在的工作就是给公司装点门面，又或许仅仅是你的某个上级拿你们组的这些看起来假大空的故事去再秀给他的上级看看，大家都是心照不宣的玩一个游戏。
  这，难道不是人生吗？公司其实仅仅是需要你来讲故事而已，它并不需要一个完整的人来操心公司战略方向。