我们持之以恒地挑选值得复现的精彩的生物信息学数据分析文章的图表作为学徒作业给大家,下面的《学徒作业》专辑里面的练习题可以配合生物信息学入门使用,也可以作为面试考核题哦!
- chatGPT只能给你提示没办法代替你解决单细胞报错
- 单细胞水平什么程度的表达才算是阳性呢
- 新冠病毒感染引起的急性呼吸窘迫综合征患者外周血有问题吗
- 如果只想知道细胞亚群比例变化无需单细胞转录组测序
- 基因是否具有单细胞亚群特异性居然是靠肉眼看
- 单细胞亚群细分这样弄可能不妥
我制作《学徒作业》专辑有两个目的,首先是希望我的二十多万粉丝里面有一些能主动研读一下我提到的文献并且尽可能的探索出不同的生物信息学数据分析方法,让我看到大家的培养潜力,我能从中挑选部分小伙伴去帮助那些有数据分析商业需求的粉丝。相当于是取之于民用之于民吧,比如: - 最低仅需800,就有一个生信工程师为你服务!
- 我以为我画错了
- 明码标价之WES等DNA测序数据找变异
- 肿瘤panel测序研究不应该公开基因列表吗
- 明码标价之10X技术单细胞(2.5万每个)(标准100G测序数据)
这样的商业委托需求每个月都有十个左右
而且这样的商业委托需求已经是持续了四五年了,我既然抛头露面把自己的知识整理成果以公众号推文的形式公开在微信,就不得不承受这份因果,大家肯定是源源不断的找我希望我可以出面帮忙分析数据。但是我个人时间精力肯定是有限的,所以三年前我就误判了这个形式,走火入魔般的雇佣了两个生信工程师,准备承担这样的个性化生物信息学业务,然后发现亏损严重,详见之前的“自传”:我是如何在一年内亏掉100万的,当时也算是引发了广泛的讨论,后台超过几百条留言,但是公众号每个推文只能精选100条,大家分别从定价角度,个性化科研角度,以及公司运营角度给出来了自己的看法。
我自己肯定是全面放弃了个性化生物信息学数据分析这个业务线,而且相关全职工程师也各奔东西,算是我给社会做的贡献吧,为社会输出人才!而且我们的《学徒作业》专辑也是源源不断的培养初出茅庐的生信工程师,让他们做个性化生物信息学数据分析肯定是难为大家了。我就会把每个月找上门来的商业委托需求按照难易程度,个性化程度分级后派发给实习生们和学徒们。
因为绝大部分商业委托需求其实是 难者不会,会者不难,比如下面的三张图,就是下载一个文献的公共数据然后针对这个单细胞转录组数据集进行降维聚类分群后提取目标亚群然后在上面可视化几个感兴趣的基因而已。对我来说,就十几分钟可以完成,收费两三千是很正常的事情。
但是我不可能亲自下场做项目,只能说把这些任务派发给实习生们和学徒们。就面临一个问题, 如果是初学者,其实上面的商业委托需求因为是 难者不会,会者不难,我可能是仅仅是需要十几分钟,但是给初学者又确实是三五天,他就会觉得辛辛苦苦加班加点的三五天工作量就收费两三千,然后就撂担子不干了。。。
这个时候,又面临了我之前同样的困境 :我是如何在一年内亏掉100万的,公司成本里面里面占大头的就是人员工资,而且员工都是初学者就导致干活效率低下,营业额少的可怜,最后几万块钱我都全款退给了各个客户。
对一个成熟的商业机构来说,甚至完成一个单细胞数据挖掘文章也就是几十分钟的事情,但是对一个兼职生信工程师来说,可能是两三个月的摸索,因为每个图表都需要学习和整理调试代码,比如下面的降维聚类分群后分组看比例,然后是恶性上皮细胞的细分。其实所有的知识点都是在我们的过往的1.3万篇生物信息学笔记里面,但是又真正有多少人在认真的学习和吸收这些技能呢?
商业委托最难的地方是谈报酬
每个工程师对自己的劳动时间的定价完全不一样,而且每个客户对生物信息学数据分析的辅助工作的认可度也完全不一样,如何让双方都满意其实是很考验项目经理的社交能力。
如果让一个项目难易程度与其接单工程师不匹配,就会出现本来是很好的兼职变成了时薪很低的折腾。但是,换句话说,如果大家都有我的能力,哪怕是起码掌握我十分之一的能力,那么不就是所有的项目都是小儿科了,手到擒来的随手捡钱的做项目的感受?
真实世界的矛盾点就在这里,明明是最适合做项目的人做了老板不愿意做项目,就好像大家也不可能说随便一个科研项目就去跟张泽民和汤富酬老师合作,或者说给多少钱也不可能让他们两个老人家亲自下场服务一个单细胞客户吧。。。
无论是华大基因还是诺禾致源,最后亲自给大家手把手服务事无巨细的讲解项目背景的,往往也是初出茅庐的初学者吧,所以对这些初学者来说也是会觉得工作难度大工作压力大,时薪太低。