回顾了一下早期整理的单细胞文献，发现了一个2022的文章《Transcriptomic diversity of cell types across the adult human brain》里面提到了一个大脑单细胞研究，是 606 high-quality samples covering 106 dissections across ten brain regions, 里面有超过300万的数量的单细胞，如下所示：
而且里面的关于大脑单细胞的第一层次降维聚类分群也是我们耳熟能详的 生物学亚群啦 ：
- neurons (INA),
- glutamatergic (SLC17A6, SLC17A7)
- GABAergic (SLC32A1) neurons,
- immune cells (PTPRC),
- vascular cells (CLDN5, ACTA2),
- fibroblasts (LUM),
- OPCs (PDGFRA, SOX10),
- oligodendrocytes (SOX10, PLP1),
- astrocytes (AQP4),
- ependymal cells (FOXJ1),
- choroid plexus (FOXJ1, TTR);
之前看到这个文章的时候就“望洋兴叹”，因为确实是超出了我的计算机资源承受范围，通常情况下我仅仅是处理30万数量级，没想过去处理这个300万个单细胞的数据集。
结果，两年过去了，马上就又 提高了一个数量级，详见：Nature | 全方位绘制小鼠大脑图谱——约3200万个细胞，鉴别出约5300个细胞类型
2023年10-12月期间Nature上接连发布了10篇关于小鼠大脑图谱的文章，该系列文章由全球多个知名研究中心发表，利用多种技术包括scRNA-seq、snRNA-seq、snm3C-seq、MERFISH（Multiplexed error-robust fluorescence in situ hybridization）、Slide-seq、STARmap、SMART-seq、snmC-seq、snATAC-seq分析了小鼠大脑总计约3200万个细胞，鉴别出约5300个细胞类型，绘制了小鼠大脑详细的单细胞分子和空间图谱。 论文链接：
- https://doi.org/10.1038/s41586-023-06824-9
- https://doi.org/10.1038/s41586-023-06819-6
- https://doi.org/10.1038/s41586-023-06805-y
- https://doi.org/10.1038/s41586-023-06823-w
- https://doi.org/10.1038/s41586-023-06808-9
- https://doi.org/10.1038/s41586-023-06818-7
- https://doi.org/10.1038/s41586-023-06812-z
- https://doi.org/10.1038/s41586-023-06817-8
- https://doi.org/10.1038/s41586-023-06638-9
- https://doi.org/10.1038/s41586-023-06569-5