蛮有意思的,看了看这个《中国生物信息学十大进展》评选活动起始于2018,恰好经历了一个疫情。从生物信息学的3个领域方向挑选成果,包括:
从上面的3个分类评选的入选的工作中进一步评选,产生每个年度“中国生物信息学十大进展”。
组织该评选的机构是:《基因组蛋白质组与生物信息学报》(Genomics, Proteomics & Bioinformatics, 简称GPB)
2018
- 中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心团队 (BIG Data Center)
- 新一代蛋白质组学开放式搜索引擎—Open-pFind
- 调控细胞自噬的蛋白质与修饰数据库—THANATOS
- 极低分辨率Hi-C数据解析的高精度算法—deDoc
- 不依赖于蛋白抗体及靶序列的开放染色质相互作用捕获技术—OCEAN-C
- RNA结合蛋白剪接调控作用的预测模型
- 基因组拼接的新方法—BAUM
- 追踪人体T细胞动态行为的新算法—STARTRAC (北京大学张泽民团队)
- 基于流形学习的三维基因组结构重构新方法—GEM
2019
- 利用单分子测序构建高质量基因组的算法—HERA
- 人类和小鼠细胞标志物数据库—CellMarker
- 基于进化基因组和功能基因组数据的灵长类特异新基因数据库 —GenTree
- 整合Hi-C和FISH重构三维基因组结构新方法—GEM-FISH
- 细胞动态行为推断算法助力肝细胞癌免疫微环境的解析 (北京大学张泽民团队)
- 小鼠三胚层谱系时空转录组图谱—eGastrulation
- 现存和古人族群的全基因组单核苷酸变异数据库—PGG.SNV
- 利用人工智能算法分析单细胞ATAC-seq数据—SCALE
- 中国人群全基因组测序研究及北方汉族参考基因组建立
- 人体肠道可培养细菌参考基因组数据集及活体菌株库—CGR
2020
- 环形RNA精准定量和可变剪接体转换识别算法—CIRIquant
- 利用单细胞测序技术构建人类细胞图谱(浙江大学郭国骥团队)
- 国家基因组科学数据中心”(NGDC)
- 基于模糊布鲁因组装图的基因组组装算法—wtdbg2(美国哈佛医学院李恒)
- 基于人工智能度量学习的单细胞类型鉴定新方法—scLearn
- 实验验证的microRNA靶基因数据库—miRTarBase
- 新冠肺炎临床信息综合数据库与人工智能诊断系统—iCTCF & HUST-19
- 新冠病毒传播动力学模型—SAPHIRE
- 单细胞转录组整合检索方法—Cell BLAST(北京大学高歌团队)
- 2019新型冠状病毒信息库(2019nCoVR)及新冠病毒基因组、变异及单体型全景及演化
2021
深度学习出镜率很高,蛮符合大家对生物信息学的“刻板印象”
2022
还是深度学习和神经网络这样的算法至上,有几个课题组多次上榜《中国生物信息学十大进展》了,应该是超级优秀!!!
当然了,《基因组蛋白质组与生物信息学报》(Genomics, Proteomics & Bioinformatics, 简称GPB)他们的官方公众号里面有这些科研成果的详细的介绍。