泛癌层面的表观调控单细胞多组学资源

美国圣路易斯华盛顿大学的Li Ding团队是TCGA计划的重要发起者和参与者,而TCGA计划大家都很熟悉了,在2012附近就产出了几十篇CNS文章,而且在2018和2020又产出了一两百的CNS子刊级别的TCGA数据挖掘成果,非常的厉害!
最近(2023年底)他们又在《Nature》杂志上合作发表了题为 《Epigenetic regulation during cancer transitions across 11 tumour types》的文章,主要是使用了snATAC-seq与snRNA-seq两个单细胞技术,量化了十几个癌症的两百多个病人的样品。可以理解为单细胞层面的TCGA计划?或者说是TCGA计划的单细胞衍生?
11种癌症类型的201名患者中获取了225个样本
让我们一起来看看这个资源吧,是泛癌层面的表观调控单细胞多组学!首先看样品数量,总共是: 225 samples from 201 patients across 11 cancer types

Comments are closed.