生信一天入门培训

• 入门资料推荐
• 首先应该学什么呢？
• 哪些是重点，必学？
• 学到哪里为止呢？
• 分清楚可以自学的和需要讲解的
• 具体该如何应用实际呢？

一、linux&&shell

• 系统管理(free,df,du,top,time,adduser,ps,kill,w)
• 去可视化(ls,cd,mkdir,cat,head,more,cp,mv,ln,awk,sed,grep,cut,wc)
• 批处理，shell 13 问
• 环境变量
• 不需要学习的(crontab,qsub,condor)

二、生物学的数据

• 中心法则(DNA-RNA-protein)
• WGS/WES/RNA-seq/ChIP-seq
• IGV可视化(bam，基因结构)
• 芯片+测序

三、软件安装及管理

• 二进制
• C源码
• java/python/perl/R ~~~
• conda

四、流程介绍

• 上游: fastq —> sam — > bam —> vcf
• 下游: 统计染色体分布，转换颠换比例等等