首发于生信菜鸟团博客:http://www.bio-info-trainee.com/2087.html
视频地址:
早期目录如下:
第一讲:GEO,表达芯片与R
第二讲:从GEO下载数据得到表达量矩阵
第三讲:对表达量矩阵用GSEA软件做分析
第四讲:根据分组信息做差异分析
第五讲:对差异基因结果做GO/KEGG超几何分布检验富集分析
第六讲:指定基因分组boxplot指定基因list画热图
第七讲:根据差异基因list获取string数据库的PPI网络数据
第八讲:PPI网络数据用R或者cytoscape画网络图
第九讲:网络图的子网络获取
第十讲:hug genes如何找
视频假设大家有R语言基础。
重新委托录制基础视频,并且我也给出了更新版教程