昨天写了,以为大家都可以很轻松做到,发现其实只是自己随心所欲罢了,第一因为自己的Mac电脑,其次因为自己看得懂R的提示,说缺依赖包,所以需要手动安装一些依赖包。
如果是Windows用户,会有一个make缺失这样的错误,如下:
虽然很多年没有使用Windows了,但实际上很容易谷歌搜索解决:
其实就是Rtools缺失问题,Windows去下载适合的版本安装即可解决。
下载安装Rtools,一次性安装到C盘(必须是C盘哦),再打开Rstudio运行packages的安装代码即可。
> packageurl <- "https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/Seurat/Seurat_2.3.4.tar.gz"
> install.packages(packageurl, repos=NULL, type="source")
> library(Seurat)
载入需要的程辑包:cowplot
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Note: As of version 1.0.0, cowplot does not change the
default ggplot2 theme anymore. To recover the previous
behavior, execute:
theme_set(theme_cowplot())
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## 迅速搞定,problem solved ~
当然,MAC用户的报错也很有趣,我们下次再讲。