发表在Int J Clin Exp Pathol 2018;文章:Up-regulation of the IRX2 gene predicts poor prognosis in nasopharyngeal carcinoma
仅仅是医院收集了病人的随访时间,检测其中一个感兴趣基因的表达量,这样的汇总数据统计就可以发文章。
然后生存分析绘图即可:
问题
其实需要仔细看文章,明白为什么研究者选择这个基因进行检测,毕竟接近100个病人,如果每个人都去做全基因组水平的表达量检测,比如RNA-seq或者基因表达芯片,自然是成本很高了,大部分的科研团队都是hold不住的。还需要做好准备,万一自己选择的基因,最后发现并没有统计学显著的生存区分效果,那又该怎么办呢?
比如,同样的100人队列,在GSE102349数据集,就可以自己验证一下咯。