发现自己搞服务器遇到的困难还是蛮多的，所以记录了一下，给菜鸟们指个路。
ubuntu对生信菜鸟来说是最好用的linux服务器，没有之一，因为它有apt-get。

很多时候大家的服务器可能并不是想联网，只是想玩一下，或者只是因为生信的某些软件要求数据库，所以大家可能会单独安装mysql，或者想学习perl的CGI模块，需要apache。

ubuntu上安装mysql

非常简单只需要几条命令就可以完成。

1. sudo apt-get install mysql-server

2. sudo apt-get install mysql-client

3.  sudo apt-get install libmysqlclient-dev

安装过程中会提示设置密码什么的，注意设置了不要忘了，安装完成之后可以使用如下命令来检查是否安装成功：

sudo netstat -tap | grep mysql

通过上述命令检查之后，如果看到有mysql 的socket处于 listen 状态则表示安装成功。

登陆mysql数据库可以通过如下命令：

mysql -u root -p

-u 表示选择登陆的用户名， -p 表示登陆的用户密码，上面命令输入之后会提示输入密码，此时输入密码就可以登录到mysql。

Ubuntu上安装Apache

在Ubuntu上安装Apache，有两种方式：1 使用开发包的打包服务，例如使用apt-get命令；2 从源码构建Apache。本文章将详细描述这两种不同的安装方式。

方法一：使用开发包的打包服务——apt-get

安装apache，在命令行终端中输入一下命令：

$ sudo apt-get install apache2

安装完成后，重启apache服务，在命令行终端中输入一下命令：

$ sudo /etc/init.d/apache2 restart

可能会出现的问题1： NameVirtualHost *:80 has no VirtualHosts，

出现上述问题的原因：定义了多个NameVirtualHost，故将/etc/apache2/ports.conf中的NameVirtualHost *:80注释掉即可。

可能会出现的问题2： Could not reliably determine the server's fully qualified domain name, using 127.0.1.1 for ServerName

原因：

根据提示，无法可靠的确定服务器的有效域名，使用127.0.1.1作为服务器域名。应此，在下面的测试中，应该使用127.0.1.1，而不是127.0.0.1！

解决：

$ vim /etc/apache2/httpd.conf，在文件中添加：

ServerName localhost:80，再次重启apache2，就可以使用127.0.0.1来访问web服务器啦！

测试：

在浏览器里输入http://localhost或者是http://127.0.0.1，如果看到了It works!，那就说明Apache就成功的安装了，Apache的默认安装，会在/var下建立一个名为www的目录，这个就是Web目录了，所有要能 过浏览器访问的Web文件都要放到这个目录里。