终于做了这个决定,把我们的单细胞转录组视频课程限时免费!是真的免费,不玩虚的!
前天在生信技能树以及单细胞天地公众号及社区跟大家讨论了,开源一些视频,也为抗击SARS-CoV-2
引起的急性呼吸疾病 COVID-19
做贡献,毕竟 华清大学、京北大学联合发现:#学习R语言之数据挖掘可抑制新型冠状病毒#,是目前有效的防范冠状病毒的手段之一。
讨论详见:我想让这个视频免费,需要你的同意 ,大家都提了很多建设性的意见,没办法做到一一采纳。折中一下,我们的决定是,把这个7个小时的单细胞转录组视频课程开源一个月!
首先呢,因为一个月后大概率上疫情也结束了,我们能为抗击疫情做贡献,就在这一个月啦!然后呢,一个月的时间限制,相当于给大家一个deadline,能显著提高大家的生产力!
- B站学习地址:https://www.bilibili.com/video/av38741055
课程内容介绍
就是讲解的R包及基础流程即可,分别是: scater,monocle,Seurat,scran,M3Drop 需要熟练掌握它们的对象,:一些单细胞转录组R包的对象 流程也大同小异:
- step1: 创建对象
- step2: 质量控制
- step3: 表达量的标准化和归一化
- step4: 去除干扰因素(多个样本整合)
- step5: 判断重要的基因
- step6: 多种降维算法
- step7: 可视化降维结果
- step8: 多种聚类算法
- step9: 聚类后找每个细胞亚群的标志基因
- step10: 继续分类
配套习题
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