昨天学徒推荐了一本书:《高通量测序技术在肺癌领域的应用》,觉得讲NGS应用实例挺好的,强烈要求我推荐给所有生信技能树的粉丝!
而且在微信读书APP里面可以免费浏览:https://weread.qq.com/web/reader/4df323307193c1ec4df6715
我看了一下,相见恨晚,花了半个小时赶紧看完了,收获颇多!里面的名词我基本上都认识,读起来超级亲切。强烈推荐所有的肿瘤学研究的硕博士都读一下,哪怕你不做肺癌研究,也不做NGS数据相关的课题。
而且我去搜索了一下,发现京东的数字内容里面,写着售价约20元,我实在是无法理解,为什么不同平台不同价格呢?微信读书这样的免费活动,不知道是否合规呢?
关于肺癌
肺癌是世界上发病率及死亡率最高的恶性肿瘤。我国75%的肺癌患者在诊断时已属晚期,5年生存率仅为仅为15%~16%。这种现状一方面与缺乏筛查有关,另一方面更与缺乏科学鉴别肺结节的方法有关。科学诊治肺结节,做好肺癌的早期诊断和早期治疗,是提高肺癌生存率、降低肺癌死亡率的重要措施。
肺癌分类
组织病理上通常将肺癌分为
- 非小细胞肺癌(non-small-cell lung cancer,NSCLC)
- 小细胞肺癌(small cell lung cancer,SCLC)
其中SCLC约占全部肺癌的15%~20%,SCLC的发病与吸烟密切相关,生物学特征为分化程度低、恶性程度高、倍增时间快、侵袭性强、预后差,中位生存期才7个月左右。
其中NSCLC又可以区分为LUSC和LUAD。
有一个网页工具文章的figure2,列出来了2015 WHO classification 的肺癌分类,From: LCE: an open web portal to explore gene expression and clinical associations in lung cancer
这本书到底好在哪里
首先,他是我目前看到的第一个也是唯一一个把NGS技术在肿瘤学领域的应用写成书的,其实就是不同ngs技术在肺癌的研究合辑,多个综述罢了,或者你可以这样理解,就相当于13个公众号推文的合辑。而且这个策略是可以完美嫁接到其它癌症研究领域,都是整理ngs技术在某个癌症的研究现状。
包括目前有多少WGS,WES,捕获测序的研究,样本量,多位点取样看肿瘤克隆进化和异质性。转录水平看癌症基因或者抑癌基因的表达失调情况,融合基因事件等等。当然,少不了大热的免疫治疗和肿瘤早筛啦,还有传说中的肠道菌群。
目录
第一章 高通量测序的概念和发展
- 第一节 NGS的发展
- 第二节 长读长的NGS测序
- 第三节 NGS测序在临床和科研中的应用
第二章 肺癌流行病学和靶向治疗
- 第一节 肺癌的诊断
- 第二节 肺癌的常见靶向治疗
- 第三节 其他靶向治疗
第三章 NGS在肺癌分子病理及其诊断决策中的应用
- 第一节 NGS对肺癌分子病理学及诊断的检测分析
- 第二节 临床应用对NGS检测的要求
第四章 NGS研究肺癌异质性和肿瘤进化
- 第一节 肿瘤异质性和肿瘤进化
- 第二节 研究肺癌异质性及进化的意义
第五章 NGS发现罕见突变基因
- 第一节 肺腺癌罕见突变基因
- 第二节 肺鳞癌罕见突变基因
- 第三节 小细胞癌罕见突变基因
- 第四节 香烟暴露与肺癌基因组改变
第六章 NGS发现肺癌基因表达异常
- 第一节 肺鳞癌基因表达异常
- 第二节 肺腺癌基因表达异常
- 第三节 小细胞肺癌基因表达异常
第七章 NGS指导治疗决策和鉴定肿瘤耐药机制
- 第一节 肺癌基因组学研究的主要内容及其临床意义
- 第二节 NGS鉴定肺癌耐药机制
- 第三节 NGS促进肺癌的研究和治疗
- 附:NCCN关于NSCLC指导用药的参考
第八章 NGS指导肺癌免疫治疗
- 第一节 免疫治疗概述
- 第二节 过继性T细胞治疗和CAR-T
- 第三节 使用NGS助力肿瘤反应性T细胞鉴定肿瘤特异性抗原
- 第四节 NGS指导免疫治疗
第九章 NGS和cfDNA辅助肺癌诊断和治疗
- 第一节 cfDNA的基本概念和特性
- 第二节 cfDNA的NGS测序方法
- 第三节 cfDNA突变检测技术
- 第四节 cfDNA在肺癌领域的最新进展
第十章 肺癌单细胞NGS测序的意义和进展
- 第一节 单细胞测序方法
- 第二节 单细胞测序的临床研究
第十一章 人体微生物测序在肺癌诊疗中的研究和发展
- 第一节 NGS和微生物研究
- 第二节 肠道微生物、口腔微生物和肺部微生物
- 第三节 微生物对肺癌发生和治疗的影响
附录 经典病例
关键词索引
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