最近我们公告了《2021生信学习班起航，先送福利》，很多朋友咨询生物信息方面的书籍，这个真的好难推荐啊！我甚至都忘记了自己还有一本生物信息学的书，见http://www.biotrainee.com/jmzeng/book/basic/，因为入门生物信息学的路实在是太多了，不同的ngs数据处理都会涵盖生物信息学的编程和统计学基础。我在B站免费NGS数据处理视频课程就很多了，已经组建了**微信交流群**的有下面这些：

• 免费视频课程《RNA-seq数据分析》
• 免费视频课程《WES数据分析》
• 免费视频课程《ChIP-seq数据分析》
• 免费视频课程《ATAC-seq数据分析》
• 免费视频课程《TCGA数据库分析实战》
• 免费视频课程《甲基化芯片数据分析》
• 免费视频课程《影像组学教学》
• 免费视频课程《LncRNA-seq数据》
• 免费视频课程《GEO数据挖掘》
• 肿瘤基因测序

每个视频课程都对应了很多国内外生信学习资源，比如《WES数据分析》就是注重于质控比对找变异，跟另外一个课程类似： https://wikis.utexas.edu/

目录结构

Day 1 - Intro to NGS, Linux and TACC

• Introduction
• Getting started at TACC

Day 2: Transferring files and TACC

• File systems and transferring files
• Running batch jobs at TACC

Day 3: Working with raw sequences

• Working with FASTQ files
• Pre-processing raw sequences

Day 4: Alignment and BAM file manipulation

• Alignment workflow

Day 5: Post-Alignment Analysis

• Filtering with SAMTools
• Analysis using BEDTools

Resources

Extras

• Obtaining public datasets from NCBI
• Visualize mapped data at UCSC genome browser
• Shell scripting
• Exercise solutions
• Catch-up
• Old stuff
• Alignment (archive)
• More Alignment exercises
• Copy of good Alignment workflow
• Samtools: viewing, counting and sorting your alignment data
• Bedtools: Analyzing your aligned experiment
• Piping and redirection
• SAM format and samtools
• Scott’s Linux one-liners
• Using TACC’s Stampede cluster
• Analysis with bedtools