闲逛推特发现了5000万数量的单细胞工作里程碑:
这个Chan Zuckerberg CELLxGENE (CZ CELLxGENE) 是由Chan Zuckerberg Initiative(CZI)支持的一个生物信息学工具,旨在促进单细胞基因表达数据的分析、可视化和共享。CZI是由Facebook创始人马克·扎克伯格和他的妻子普莉希拉·陈(Priscilla Chan)于2015年创立的慈善机构,其使命之一是推动生命科学研究领域的技术创新和数据共享。
CZ CELLxGENE 提供了一个强大的在线平台,用于处理和探索单细胞RNA测序数据。它的主要特点包括:
- 数据导入和处理:CZ CELLxGENE 支持导入和处理单细胞RNA测序数据,用户可以上传自己的数据或者使用公开可用的数据集。
- 数据分析:该工具提供各种数据分析功能,包括差异基因表达分析、聚类分析、细胞亚型识别和细胞轨迹分析等。用户可以使用这些功能来挖掘数据中的生物学信息。
- 可视化:CZ CELLxGENE 具有强大的数据可视化工具,用户可以生成各种图表和图形,以更好地理解数据。这些可视化工具包括降维可视化、热图、散点图等。
- 数据共享:平台允许用户将他们的数据和分析结果分享给其他研究人员,促进合作和数据共享。
- 生态系统整合:CZ CELLxGENE 与其他生物信息学工具和资源进行了整合,以便用户可以无缝地使用不同的工具来处理和分析数据。
我特意去它官方网站看了看:
确实很让人激动,不仅仅是有如此数量级的单细胞数据,而且还分门别类整理存放好,供大家使用:
- https://cellxgene.cziscience.com/collections
标准元数据注释的数据集可以下载 AnnData 和 Seurat 格式。
是不是可以去他们那边工作呢 ?