过去的三五年,我们在单细胞数据分析的方方面面都写了很多笔记,而且已经形成了一套成熟的降维聚类分群代码。
但是因为偏向于数据处理的教学,所以仍然是有不少的小伙伴们在后台问写作的事情,这个其实主要是靠海量的文献阅读,博采众家之长。文字版教程写起来很累很累,我们也确实是有一个专辑,在推文小鼠糖尿病肾病(DKD)的单细胞转录组图谱-1中可以看到100个常见的单细胞文献图表解读。这里推荐一个b站免费视频,相信对大家的单细胞数据发文章会很有帮助。链接:https://www.bilibili.com/video/BV1py4y1K7bZ/
以下是整理好的课程目录,包括各讲的主题和持续时间:
- 第1讲 单细胞技术的现状及未来 - 45:57
- 第2讲 拆解单细胞技术在肿瘤异质性研究中的研究思路 - 25:19
- 第3讲 单细胞视角下的肿瘤发生发展机制探索 - 43:44
- 第4讲 单细胞技术挖掘下一个肿瘤临床诊疗的里程碑 - 30:39
- 第5讲 单细胞分辨率下的肿瘤微环境探索 - 28:35
- 第6讲 寻因生物单细胞产品及服务 - 25:04
- 第7讲 单细胞测序取送样指南 - 25:00
- 第8讲 如何判断细胞悬液质量优劣? - 33:35
- 第9讲 单细胞测序之心中有数-全程质控 - 24:12
- 第10讲 单细胞悬液优化处理解决方案 - 33:02
- 第11讲 如何解离出高质量的单细胞悬液? - 20:07
- 第12讲 疑难样本解离之手到擒来 - 37:27
- 第13讲 单细胞数据结构梳理与基本分析逻辑 - 42:52
- 第14讲 单细胞测序数据及文库结果的质量控制 - 37:08
- 第15讲 细胞注释方法介绍和要点解析 - 41:08
- 第16讲 基因表达与功能分析 - 1:01:25
- 第17讲 单细胞高级分析-看懂轨迹分析结果 - 27:25
- 第18讲 单细胞高级分析-看懂细胞间相互作用结果 - 26:23
- 第19讲 单细胞高级分析-看懂转录因子调控结果 - 13:18
- 第20讲 单细胞多组学联合与后续验证实验设计思路 - 36:23
- 第21讲 那些你必须了解的单细胞公共数据库 - 22:44
- 第22讲 单细胞研究热门期刊投稿攻略国自然基金查询、标书写作全攻略 - 1:02:44
- 第23讲 如何高效完成单细胞文献调研-讲师苏翠珠 - 32:24
- 第24讲 网络绘图软件-Cytoscape操作指南 - 1:34:29
- 第25讲 科研绘图软件-AI操作指南 - 1:51:35
这个目录涵盖了单细胞技术从基础知识、研究思路、实验操作、数据分析到科研绘图等多个方面的讲座内容。