前面我分享了自己踩坑的经历，就是：底层架构真的折磨死个人（急，在线等），很多人表明其实没有看懂我遇到的问题。 Continue reading →

小白学员好不容易跟完了生信技能树的马拉松式数据挖掘课程，见：

• 数据挖掘学习班第5期（线上直播3周，马拉松式陪伴，带你入门），原价4800的数据挖掘全套课程， 疫情期间半价即可抢购。 Continue reading →

芯片分析中经常会遇到Affymetrix Human Transcriptome Array 2.0芯片，由于目前还没有现成的R包可以用，因此分析方法也不统一。见生信技能树Jimmy老师HTA2.0芯片比较麻烦，其实这类常见的有3个平台，3种类型： Continue reading →

R语言对临床医师/医学生来说已经是最容易学的编程语言了，相比起C语言，python，java，PHP来说。可能把大多数人挡在门外的就是R包安装了，因为我们之所以会选择R语言，就是因为它丰富的第三方包，可以不费吹灰之力实现大量的统计可视化。 Continue reading →

目前单细胞转录组以10X公司为主流，我们也是在单细胞天地公众号详细介绍了cellranger流程，大家可以自行前往学习，如下： Continue reading →

前些天发布了：生信技能树知识整理实习生招募，提出来的其中一个方向就是单细胞研究动态追踪，比如北京大学张泽民教授团队的文章， 哈佛大学Broad研究院的 Aviv Regev 博士及其团队的文章，MD Anderson癌症中心 Nicholas E. Navin博士及其团队的文章整理。 Continue reading →

前面的 10个小时搞定科目一，大家留言比较多的希望我出一个教程：快速搞定科二，我笑而不语！ Continue reading →

数学意义上的细胞分群，并不能作为最终结果哦！
最近看到一个单细胞转录组文章：Published in final edited form as:
Conf Proc IEEE Eng Med Biol Soc. 2018 July ; 2018: 2378–2381. doi:10.1109/EMBC.2018.8512784.
Single-Cell Transcriptomics Reveals Heterogeneity and Drug Response of Human Colorectal Cancer Organoids Continue reading →

近日，微信群里的宝藏唐医生在群里甩了一个百度云链接，我瞅了一眼，居然是20G，而且命名超级诡异，是9044782e-cb96-4733-8a4f-bf42c21399e6_v1.0.zip。 Continue reading →

不得不说，现在各种软件系统的版本更新都好迅速！

一般来说，新安装的ubuntu系统都太干净，缺很多库文件，下面的代码先运行一波！ Continue reading →

太多朋友不理解，为什么信技能树官方举办的学习班：

• 数据挖掘学习班第5期（线上直播3周，马拉松式陪伴，带你入门），原价4800的数据挖掘全套课程， 疫情期间半价即可抢购。 Continue reading →

如果你的服务器在中国大陆，基本上就放弃prefetch啦，直接aspera即可。但是如果是在海外，就可以尝试比较prefetch和aspera下载速度。 Continue reading →

众所周知，在R里面使用cor函数可以计算两个向量的相似情况，有两个参数尤为需要注意： Continue reading →

最近接收到粉丝的求助，说她安装一个包data.table失败了，提示她R包data.table依赖于最新的4.0以上，所以被迫升级了R，结果仍然是搞不定它，又降级为3.6，折腾了三天三夜，仍然是折戟沉沙在包data.table上面。 Continue reading →

虽然我这七年在生信技能树、生信菜鸟团、单细胞天地写了几万篇教程，制作了几百个小时的教学实战演练视频课程，都是免费分享在各大网站（B站，知乎，简书，博客，GitHub，微云），但我也并不是什么都会，比如蛋白质组和代谢组以及宏基因组我就没有机会去尝试，必然就不可能制作它们的数据处理视频。凡是我会的，录制了视频的，都会组建好交流群，见： Continue reading →

大家很容易陷入一种误解，数据挖掘就是要去灌水，发SCI文章。其实真正是数据挖掘，是高效的利用好已有的科研成果，避免重复性的设计实验浪费纳税人民的钱。 Continue reading →

大家很容易陷入一种误解，数据挖掘就是要去灌水，发SCI文章。其实真正是数据挖掘，是高效的利用好已有的科研成果，避免重复性的设计实验浪费纳税人民的钱。 Continue reading →

凡是我会的生物信息学数据分析技能，都录制了视频的，而且组建好交流群，见：

• 免费视频课程《RNA-seq数据分析》
• 免费视频课程《WES数据分析》
• 免费视频课程《ChIP-seq数据分析》
• 免费视频课程《ATAC-seq数据分析》 Continue reading →

不知不觉我们生信技能树的每月赠送活动也走过了两个年头，首先感谢图灵出版社的始终如一的支持，然后感谢生信技能树几位负责的小编接力完成了粉丝挑选，活动策划： Continue reading →

十多年前的普通转录组一个样品测序跟现在的单细胞转录组类似，成本也是一两万块钱，然后随便五六个样本分两组做一下差异分析，富集到通路就是一个文章。但是这些年过去了，转录组已经深入到生命科学领域的方方面面，区别是它不再是唯一的主角，现在转录组不到一千块钱一个样品，只要你有好的课题思路，好的实验设计，让转录组为你的课题增光添彩吧！ Continue reading →