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生信菜鸟养成手册

生信菜鸟养成手册

背景:生物小本,懂做一些分子实验,了解一些生物背景知识。

目标:成为生信菜鸟,找到一份生物信息学相关的工作。

1、计算机基础(linux+perl+R 或者 python+matlab)

2、生信基础知识(测序+数据库+数据格式)

3、生信研究领域(全基因组,全转录组,全外显子组,捕获目标区域测序)

4、生信应用领域(肿瘤筛查,产前诊断,流行病学,个性化医疗)

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Trinity进行转录组组装的使用说明

Trinity进行转录组组装的使用说明

一:下载安装该软件

去官网下载trinity并解压安装   http://trinityrnaseq.github.io/

安装非常简单,一个make即可

这个软件比较大,约150M。所以安装需要一会时间,以下是安装进程日志,可以看出trinity这个软件安装的同时还附带着好几个测序一起安装进来了。

Trinity转录组组装软件说明书452

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