我在生信技能树分享了一个教程：不要怀疑，你的基因就是没办法富集到统计学显著的通路，强调了大家做生物信息学数据分析的同时，一定要加强统计学基础，比如把差异基因集（500个左右的基因）富集到KEGG数据库通路，本质上就是对每个通路单独做一次超几何分布检验罢了！ Continue reading →

前面我们详细讲解过，sanger研究所科学家【1】提出来了肿瘤somatic突变的signature概念 ，把96突变频谱的非负矩阵分解后的30个特征，在cosmic数据库可以学习它。不同的特征有不同的生物学含义【2】，比如文章【3】 就是使用了 这些signature区分生存！主要是R包deconstructSigs可以把自己的96突变频谱对应到cosmic数据库的30个突变特征。 Continue reading →

我在单细胞天地教程：表达矩阵逆转为10X的标准输出3个文件，详细介绍过 10X文件的3个标准文件： Continue reading →

上周五在三亚摘完芒果就飞往上海见了一下学徒，本来计划是周一飞往山西太原，有意思的是他们防疫政策很高效，要求所有的广东人都需要做核酸检测以及隔离，我就呵呵一下，果断不去了。恰好我的教练发朋友圈说科目一考场开放了，就报名约考周三上午。这样我周一飞回去休息下，第二天有一整个白天时间备考科目一，完美！ Continue reading →

早在2015年，那时候我进入生信领域还不满两年，就看到了一则新闻，说百度CEO李彦宏将个人捐赠3000万元，支持百度与北京协和医学院针对食管癌基因组研究的合作。 Continue reading →