数据挖掘真的是把人逼到花样百出，我们《生信技能树》作为华语圈生物信息学自媒体界扛把子自然也是被各种开脑洞的思路“骚扰”着，不过大家请不要无限制的怼我的私人微信哈，如果提问，在公众号推文文末留言即可，或者发邮件给我，我的邮箱是 jmzeng1314@163.com

最近收到一个有意思的留言，是关于10X这样的单细胞转录组里面的非编码基因的， 目前绝大部分表达量矩阵都是以基因名字为单位，很容易区分成为编码和非编码，我们仍然是以 pbmc3k 这个数据集举例子哈。 Continue reading →

突然间发现我们的RNA速率分析笔记仅仅是分享了在Linux操作的部分，见：使用基于python的velocyto软件做RNA速率分析，已经是2021年7月的事情了。 Continue reading →

最近各个交流群总是看到大家询问一些单细胞公共数据集处理，居然是从bam文件开始，可能是因为都是从ENA数据库下载吧。

比如文章：《Defining the emergence of myeloid-derived suppressor cells in breast cancer using single-cell transcriptomics》，其数据在 https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJNA578550?show=reads ： Continue reading →