前面我们视频号直播了一个表达量芯片数据处理，详见：这样去除表达量芯片的批次效应可能不妥，这个物信息学数据挖掘的标题是：《Novel ferroptosis gene biomarkers and immune infiltration profiles in diabetic kidney disease via bioinformatics》，直播回放的视频在： Continue reading →

前面我们已经分享过一次10x技术空间单细胞上游定量案例，详见： 空间单细胞的上游定量流程（spaceranger，10x技术）, 不过这样的分析理论上需要跑四五次才能算是完全掌握。所以我们接下来分享E-MTAB-12043数据集的： Continue reading →

• https://www.ebi.ac.uk/biostudies/arrayexpress/studies/E-MTAB-11940
• https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB54644

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转录组测序后差异分析大家应该是都不陌生了，现在的生命科学领域的研究如果不加入一个转录组都会让人很奇怪，慢慢的它的地位开始赶上传统的PCR（聚合酶链反应）或者Western Blot（WB，蛋白质印迹）等技术。
如果一个转录组测序项目只有两个分组，那么简单的单次差异分析即可。但是如果有3分组就麻烦了，简单的理解就是两个处理组去和一个对照组差异，然后这两次差异分析的结果可以去对比一下，比如取交集。如下所示的案例： Continue reading →