前面我带领大家通过IMGT数据库认知免疫组库，而且也一起从IMGT数据库下载免疫组库相关fasta序列，免疫组库重要的研究对象就是分成BCR的IGH,IGK,IGL这3类，以及TCR的TRA,TRB,TRD,TRG，它们各自都有V，D（可选），J，C基因。 Continue reading →

其实前面我们已经分享了MiXCR，还有igblast，这两个免疫组库上游分析软件已经够用，如下： Continue reading →

前面我带领大家通过IMGT数据库认知免疫组库，而且也一起从IMGT数据库下载免疫组库相关fasta序列，免疫组库重要的研究对象就是分成BCR的IGH,IGK,IGL这3类，以及TCR的TRA,TRB,TRD,TRG，它们各自都有V，D（可选），J，C基因。 Continue reading →

不出意外，朋友圈又被六一儿童节刷屏了，但是我微信里面没有一个“儿童”，有意思。
成年人了，面对现实吧，我在生信技能树分享的1.3万篇教程你肯定没有看完，我在B站共享的公益100个小时教学视频你大概率也是没有看完。学习资料及学习内容在：2020学习主旋律，B站74小时免费教学视频为你领路。 Continue reading →

做梦吧你！
任何一个细节知识点的掌握如果背后是四年本科的沉淀，学起来倒是很快，这也就是为什么我给学生强调，学会一个R包跟“吃饭喝水”一样简单。 Continue reading →

我在生信技能树分享了一个教程：不要怀疑，你的基因就是没办法富集到统计学显著的通路，然后在生信菜鸟团给了一个解决方案：差异基因没办法富集到通路你就放弃了吗，但是他们都是基于转录组表达量来的，这并不意味着GO/KEGG这样的生物学功能数据库的注释仅仅是只能针对转录表达的数据。 Continue reading →

如果你感兴趣三维基因组数据分析，那么这个课程不容错过啦！

课程安排

报名后会统一发送课前培训资料，包括Linux和R基础。因为此课程（三维基因组数据分析实操）时间安排是一整天，也不会有时间去详细讲解Linux和R语言基础知识的，需要你自行学习编程基础知识哈，学习资料及学习内容在：2020学习主旋律，B站74小时免费教学视频为你领路，这个计算机背景我默认生信技能树绝大部分粉丝都已经是没有问题了哈，如果还有疑问，自行完成Linux和R的视频学习以及作业题。务必把2020学习主旋律，B站74小时免费教学视频为你领路多看几遍！！！ Continue reading →

前面我在单细胞天地的教程：10X单细胞转录组理论上有3个文件才能被读入R进行seurat分析，预告了一个粉丝遇到的疑难点，数据集GSE127465里面明明是可以下载到看起来是10X标准的3个文件，但是的确没办法读入到R里面进行seurat流程。 Continue reading →

前面我带领大家通过IMGT数据库认知免疫组库，而且也一起从IMGT数据库下载免疫组库相关fasta序列，免疫组库重要的研究对象就是分成BCR的IGH,IGK,IGL这3类，以及TCR的TRA,TRB,TRD,TRG，它们各自都有V，D（可选），J，C基因。 Continue reading →

静态网站内容爬取rvest、RCurl、XML这几个包都可以实现这个功能。比如下面的网页：

• http://vip.stock.finance.sina.com.cn/q/go.php/vInvestConsult/kind/xsjj/index.phtml?num=20&p=
  很明显看到，页面有一个表格： Continue reading →

居然有粉丝咨询我黑色素瘤和小耳畸形这两个疾病的关系，其实我蛮吃惊的，因为我一直分享的都是纯粹的数据处理技术，基本上不会涉及到疾病的认知层面，因为我确实没有医学背景，甚至也不会去谈论那些生信数据挖掘文章套路，因为感觉很low！ Continue reading →

DNA损伤反应（DNA damage response，DDR）这个防御机制是生物体维护基因组稳定性的重要途径，DDR缺陷可导致包括肿瘤在内的多种疾病的发生，DDR通路已经成为抗肿瘤药物靶点，其中最突出的药物就是PARP抑制剂。所以也会有各式各样的研究关注多种癌症的DDR通路的基因。 Continue reading →

我这七年写了几万篇教程，制作了几百个小时的教学实战演练视频课程，都是免费分享在各大网站（B站，知乎，简书，博客，GitHub，微云），必然会出现部分教程过时，一些资料缺失（主要是链接失效）。而且很多平台都是生信技能树的各个志愿者帮忙打理，我不可能要求大家伙在辛辛苦苦帮我整理和发布资料的同时还提供答疑。比如这几天在登陆b站，就看到了“铺天盖地的”留言和私信，比如： Continue reading →

我这七年写了几万篇教程，制作了几百个小时的教学实战演练视频课程，都是免费分享在各大网站（B站，知乎，简书，博客，GitHub，微云），必然会出现部分教程过时，一些资料缺失（主要是链接失效）。而且很多平台都是生信技能树的各个志愿者帮忙打理，我不可能要求大家伙在辛辛苦苦帮我整理和发布资料的同时还提供答疑。比如这几天在登陆b站，就看到了这两年来积累的“铺天盖地的”留言和私信，我已经在：免费视频课程《RNA-seq数据分析》交流群组建通知 列出来了。 Continue reading →

昨天有粉丝看到了 转录组公益课（含单细胞）(名额有限，先到先得)，发邮件给我说，实在是太激动了，之前去了解了各种单细胞培训班，动辄好几千而且才两天课程，很多都是“挂羊头卖狗肉”。但是导师一直push他去外面参加培训，舟车劳顿不说，还基本上没有收获。因为导师觉得免费的，或者低价的，肯定质量很差。 Continue reading →

没有服务器的生信工程师就好似武侠小说中江湖上没有兵器的大侠，战斗力大打折扣。我们生信技能树联合「云筏-科研云」在 《共享生信云服务器（64线程256G内存）内测半价活动》 基础上，精心准备好了3套成型的生信云，献给即将或者已经成为生信工程师的你们！ Continue reading →

基因测序包括全基因组，全外显子组，以及捕获基因测序，不同技术研究的基因组范围不一样，都有自己合适的方向。还有另外一种分类是基于生物学应用，比如肿瘤外显子，家系外显子等等。 Continue reading →

号外：绝大部分生信技能树粉丝都没有机会加我微信，已经多次满了5000好友，所以我开通了一个微信好友，前100名添加我，仅需150元即可，3折优惠期机会不容错过哈。我的微信小号二维码在：0元，10小时教学视频直播《跟着百度李彦宏学习肿瘤基因组测序数据分析》 Continue reading →

看到我们生信技能树的教学群有学员提问这样的图如何绘制： Continue reading →

最近在生信技能树分享了几个miRNA的靶向基因的查询工具，分别是：

• microRNAs靶基因数据库哪家强
• 使用miRNAtap数据源提取miRNA的预测靶基因结果
• 对miRNA进行go和kegg等功能数据库数据库注释 Continue reading →