可变剪切是指mRNA前体以多种方式将exon连接在一起的过程。 由于可变剪切使一个基因产生多个mRNA转录本，不同mRNA可能翻译成不同蛋白。
可变剪切背景知识
转录组一般是指从细胞或组织的基因组所转录出来的RNA的总和，包括编码蛋白质的mRNA和各种非编码RNA（rRNA,tRNA,snRNA,snoRNA,lncRNA,microRNA等）。真核生物的基因结构是不连续的，如下图：
十二
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十一
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生信技能树论坛-组学大全板块-表观组
如果你是最近关注我们，你将又知道一个学习生信的好地方；
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那就是我们的生信技能树论坛(附上网址：http://www.biotrainee.com/forum.php
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今天给大家推送：组学大全板块-表观组
作者：中科院-徐鹏
十一
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生信技能树论坛的生信基础板块-可视化
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今天给大家推送：可视化版块
作者：钱胜
十一
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WES技术找突变的黑名单
文章作者通过分析 dbSNPv138 and ESP6500 数据库之后找到了 100个高频突变基因，然后跟其它几个数据库进行比较。文章题目是：FLAGS, frequently mutated genes in public exomes，https://bmcmedgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12920-014-0064-y
十一
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生信技能树论坛的生信基础板块-统计学
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今天给大家推送：生信基础板块-统计学
作者：王HH
十一
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使用cnvkit来对大批量wes样本找cnv
cnvkit被设计来处理同一个批次的多个肿瘤配对样本测序情况，首先对所有的normal数据进行bin处理拿到背景值，然后就这个背景值来处理所有的tumor测序数据计算拷贝数变异情况。
该软件使用比较复杂，建议读一读官网教程。所有的命令都被包装到一个python脚本里面，使用该脚本调用一系列字命令，如下：
十一
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生信技能树论坛的生信基础板块-在线应用-网页版工具
本周专题是介绍
生信技能树论坛的生信基础板块，本篇是其中的“在线应用-网页版工具“版块，会对目前此子版块中的文章进行一个汇总整理（截止2017.11.26）。
本章节作者：hope
十一
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生信技能树论坛-生信基础版块介绍-计算机基础
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今天给大家推送：计算机基础
作者：华农-钱胜
十一
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生信技能树论坛-生信基础版块介绍-生物学基础
# 生信技能树论坛-生信基础版块介绍-生物学基础
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今天给大家讲解：生物学基础板块
作者：lakeseafly
十一
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生信技能树论坛-生信基础-医疗相关应用板块导读
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生信技能树论坛-生信基础版块介绍-测序基础
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作者：梅零落
十一
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外显子测序流程-文章里面的
就是做一个图床而已，需要这个图片的网页url链接，没别的意思！ Continue reading
十一
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生信完全入门线路图及资源大全
生信完全入门线路图及资源大全
成为一个合格的生信工程师必经之路
6大基础知识的掌握
首先你需要了解一些测序基础知识，生物学基础知识，这个主要靠自己看，还有平时多积累。 Continue reading
十一
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it’s extremly easy to use firehose_get to download TCGA data
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About firehose
This website is maintained by Broad Institute, the url is : http://firebrowse.org/ , and all of the TCGA data are stored in below urls : Continue reading
十一
09
探索转录本的可变剪切
十一
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850K甲基化芯片数据的分析
公众号文章，作者是北京基因组所，任云晓
本文是看到生信技能树有个450K甲基化芯片数据处理传送门，我呢，恰好不久前用一个集成度很高的ChAMP包分析过850K的甲基化芯片数据。所以，就想着把自己的笔记整理下，可以和更多的小伙伴学习交流，还有个原因可能是因为这是四月份打算学生信时，接手的第一个任务，曲曲折折好几个月才跑通流程，遇到的坑也比较多，想记录下来。
十一
06
linux 命令中英文对照，收集
十一
02
我是如何学习Gene Fusion分析的
我是如何学习Gene Fusion分析的
一、Fusion原理
基因融合（Gene fusion）是指将两个或多个基因的编码区首尾相连，置于同一套调控序列（包括启动子、增强子和终止子等）的控制之下，构成嵌合基因。基因融合通常是由于染色体重排所造成的。异常基因融合事件可以引起恶性血液疾病以及肿瘤的发生，所以通过分析基因融合现象将有助于探讨发病机制、biomaker的筛选等，临床意义重大。 Continue reading
十一
02
一个植物转录组项目的实战
其实这个植物是拟南芥，所以跟人类研究的数据处理大同小异。
转录组
转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有 RNA 的总和，包括 mRNA 和非编码 RNA 。通过转录组测序，能够全面获得物种特定组织或器官的转录本信息，从而进行转录本结构研究、变异研究、基因表达水平研究以及全新转录本发现等研究。 Continue reading
十一
02
LncRNA课题整体解决方案平台
LncRNA是一类长度超过200nt的非编码RNA分子，人类基因组中只有约3%的序列编码蛋白质，除去非转录区，其余约70%的序列转录产生非编码RNA (non-coding RNA,ncRNA )。以往被认为是Junk DNA的基因组序列，现在被证实很多转录后变成了长非编码RNA。因此，LncRNA领域的研究堪比哥伦布发现的新大陆。随着高通量测序技术的发展，越来越多的LncRNA被注释。然而绝大多数LncRNA的功能效应及效应机制尚不得而知，探索这一广阔的未知领域正逐渐成为当今生物医学最热门的研究领域之一。