转录组方向：

数据来源是NCBI里面的一个文献

其中转录组方向的那些软件流程大多已经跑完了，大家可以见我的转录组总结。

trinity，tophat，cufflinks，RseQC，RNAseq，GOseq，MISO，RSEM，khmer，screed，trimmomatic，transDecoder，vast-tools，picard-tools，htseq，cuffdiff，edgeR，DEseq，funnet，davidgo，wego，kobas，KEGG，Amigo，go

基因组方向：

数据来源是strawberry草莓的文献

velvet，SOAPdenovo2，repeatmasker,repeatscount,piler，

Chip-seq方向：

这个群里有高手说要跟我合作，他来帮我写，希望是真的！

免疫组库方向：

这个其实没有成熟软件，也就是一个igblastn, 然后是IMGT数据库，但是是我主打的产品，所以我会详细介绍一下。

全外显子组方向：

这方面我不是很懂，。好像主要就是snp-calling

Snp-calling方向：

这个我准备自己写软件，不仅仅是用别人的软，它的数据本身也是前面几个方向的数据

bwa，bowtie，samtools，GATK，VarScan.jar，annovar

进化方向：

数据就是基因组数据

orthMCL，inparanoid, clustw,muscle，MAFFT，quickparanoid，blast2go，RAxML，phyML