有很多读者来信,CHIP-seq数据比对后的bam文件如果根据基因组的所有基因来画热图,profile图呢?
十二
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用pheatmap来绘图首先要安装这个包,它就一个功能,画出热图即可,号称是pretty heatmap,的确比其它的好用很多。我以前写过《一步一步学习heatmap.2》的教程,很简单的那种,所以就没有公布在博客上面,结果发现很多其它博客居然能先我一步发出。其实包括本次的pheatmap指南,都没什么好发,的在R里面也是傻瓜式出图,无法就是自己熟练一下参数而已,又不是开发一个包,没什么技术含量。我这里单独提一下pheatmap是因为它的确非常好用,将会是我画热图的不二之选。比如下面这个,是我最喜欢的: Continue reading