再次强调一下,R里面实现生存分析非常简单!
用my.surv <- surv(OS_MONTHS,OS_STATUS=='DECEASED')构建生存曲线。用kmfit2 <- survfit(my.surv~TUMOR_STAGE_2009)来做某一个因子的KM生存曲线。用 survdiff(my.surv~type, data=dat)来看看这个因子的不同水平是否有显著差异,其中默认用是的logrank test 方法。用coxph(Surv(time, status) ~ ph.ecog + tt(age), data=lung) 来检测自己感兴趣的因子是否受其它因子(age,gender等等)的影响。