十二 29

自动化出网页报告的R语言包-Nozzle

Posted on 2015年12月29日 by ulwvfje

挺好用的：https://confluence.broadinstitute.org/display/GDAC/Nozzle

http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/29/8/1089.full.pdf+html

自动化出生物信息学分析报告：

一个简单的例子：https://raw.githubusercontent.com/parklab/Nozzle/develop/examples/basic.R

挺好玩的

开发者自己就用这个包写了一大堆的自动化报告；

http://gdac.broadinstitute.org/runs/analyses__latest/reports/cancer/OV/Mutation_Assessor/nozzle.html

很牛！

还有很多其它例子：https://github.com/parklab/Nozzle/tree/develop/examples

功能还是很多的，https://cran.r-project.org/web/packages/Nozzle.R1/Nozzle.R1.pdf

根据测试代码输出的报告如下：

clipboard

这些报告里面的元素，都是测试代码添加的，很容易就能理解