前面讲到affy处理的芯片平台是有限的，一般是hgu 95系列和133系列，[HuGene-1_1-st] Affymetrix Human Gene 1.1 ST Array这个平台虽然也是affymetrix公司的，但是affy包就无法处理 了，这时候就需要oligo包了！
oligo包是R语言的bioconductor系列包的一个，就一个功能，读取affymetix的基因表达芯片数据-CEL格式数据，处理成表达矩阵！！！
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用affy包读取affymetix的基因表达芯片数据-CEL格式数据
Affymetrix的探针（proble）一般是长为25碱基的寡聚核苷酸；探针总是以perfect match 和mismatch成对出现，其信号值称为PM和MM，成对的perfect match 和mismatch有一个共同的affyID。
CEL文件：信号值和定位信息。
CDF文件：探针对在芯片上的定位信息
affy包是R语言的bioconductor系列包的一个，就一个功能，读取affymetix的基因表达芯片数据-CEL格式数据，处理成表达矩阵！！！
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一个表达芯片数据处理实例
这个实例上部分包括：
如何用R包下载GEO数据(只限单一平台，其余平台需要修改下面的代码)
如何对GEO的芯片数据归一化并且得到表达量矩阵，
如何用limma包做差异分析，
对找到的差异基因如何做GO和KEGG注释