前面我讲到TCGA的数据可以在5个组织机构可以获取，他们都提供了类似的接口来供用户下载数据

每个接口都有使用教程，比如http://firebrowse.org/tutorial/FireBrowse-Tutorial.pdf

非常详细！！！

有的还专门写了软件接口：https://confluence.broadinstitute.org/display/GDAC/Download

或者写了R的接口：http://www.cbioportal.org/cgds_r.jsp

接下来我们要讲的就是cbioportal网站提供的一个R接口，非常好用，只需记住4个函数即可！！！ Continue reading →