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用GISTIC多个segment文件来找SCNA变异

这个软件在TCGA计划里面被频繁使用者,用这个软件的目的很简单,就是你研究了很多癌症样本,通过芯片得到了每个样本的拷贝数变化信息,芯片结果一般是segment结果,可以解释为CNV区域,需要用GISTIC把样本综合起来分析,寻找somatic的CNV,并且注释基因信息。

有两个难点,一是在linux下面安装matlab工作环境,二是如何制作输入文件。

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