十一 10

一个基因在同一套基因组上面竟然有两个定位!

查了好久的bug,终于搞清楚问题所在了!因为要对基因进行reads计数,所以要拿到基因在基因组上面的染色体起始终止坐标,结果发现了个十分诡异的现象,很多基因有多个坐标,比如下面这个PTPRS 在hg38这个基因组版本,居然有两个定位,因为我是写程序格式化得到的坐标,所以我check了我的程序,http://www.biotrainee.com/thread-472-1-1.html  感兴趣的同学可以点开看看我的代码!

tmp
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