因为一直拿到的是公司给的特别好的数据，所以没太关注质控这个问题，最近拿到了raw data，才发现其实里面的门道挺多的。前面都是用cutadapt这个python软件来去除接头的，但是它有一个弊端，需要自己指定接头文件。正好朋友推荐了trimmomatic，是java软件，所以直接Google找到其官网，然后下载二进制版本解压即可使用！